RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDCL2Q8N4E4 241 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00301Q8NCQ3 95 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 E2F7Q96AV8 911 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACCSQ96QU6 501 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM213AQ9BRX8 229 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 IER2Q9BTL4 223 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 BACH2Q9BYV9 841 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PANK2Q9BZ23 570 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 TASP1Q9H6P5 420 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 HPS4Q9NQG7 708 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 OBP2AQ9NY56 170 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 DLL3Q9NYJ7 618 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 DSEQ9UL01 958 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCL26Q9Y258 94 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACACBO00763 2458 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 GABRDO14764 452 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 STAT6P42226 847 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 TUFMP49411 452 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXK2Q01167 660 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 EHHADHQ08426 723 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 POSTNQ15063 836 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SDHAF4Q5VUM1 108 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ITIH5Q86UX2 942 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CMTM8Q8IZV2 173 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDILTQ8N807 584 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR5B17Q8NGF7 314 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTC8Q8TAM2 541 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 BPIFB1Q8TDL5 484 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF560Q96MR9 790 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PI4K2AQ9BTU6 479 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTMR12Q9C0I1 747 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCIF1Q9H4Z3 704 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PANK4Q9NVE7 773 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 GDAP2Q9NXN4 497 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM131Q92545 1883 aa9.1□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CACNA1EQ15878 2313 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 TGFB1I1O43294 461 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 STX6O43752 255 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 EXTL3O43909 919 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP2C2O75185 946 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOL4O94818 638 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 LDHAP00338 332 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 IDEP14735 1019 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDC25CP30307 473 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCR3P51677 355 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMARCB1Q12824 385 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALCAMQ13740 583 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PON2Q15165 354 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOWAHAQ2M3V2 549 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM68Q6AZZ1 485 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SHC4Q6S5L8 630 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 METTL23Q86XA0 190 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CBWD2Q8IUF1 395 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 THEM5Q8N1Q8 247 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPD1LQ8N335 351 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRC52Q8N7C0 313 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAB21L3Q8N8X9 362 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATRIPQ8WXE1 791 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 MSANTD3Q96H12 275 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYRFLQ96LU7 910 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC22A12Q96S37 553 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACBD6Q9BR61 282 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM9Q9C026 710 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNMDQ9H2S6 317 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 INTS13Q9NVM9 706 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 GTF3C4Q9UKN8 822 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 EXOC7Q9UPT5 735 aa9.09□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms