RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 PTP4A2Q12974 167 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 B3GALT6Q96L58 329 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHGC3Q9UN70 934 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 CLDN5O00501 218 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 PFKMP08237 780 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 TTC30AQ86WT1 665 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 RFFLQ8WZ73 363 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 NUP85Q9BW27 656 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 SYN1P17600 705 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 CNGA2Q16280 664 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 MFSD5Q6N075 450 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 CPXM1Q96SM3 734 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 NCANO14594 1321 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 GABRDO14764 452 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 PTPN20Q4JDL3 420 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM209Q96SK2 561 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 CTAGE9A4FU28 777 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 BTNL10A8MVZ5 291 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 NRP1O14786 923 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 GPD2P43304 727 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 RGS7P49802 495 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 UNC93AQ86WB7 457 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM35BQ8NCS4 154 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM58Q8NG06 486 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 MED7O43513 233 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 MMP8P22894 467 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 CXCR5P32302 372 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC57Q8N9N7 239 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 BADQ92934 168 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 ST7Q9NRC1 585 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 VWA8A3KMH1 1905 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP1A2P05177 515 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC11A1P49279 550 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 EPHB4P54760 987 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 DAAM2Q86T65 1068 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 ERICH1Q86X53 443 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 TSC2P49815 1807 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF185O15231 689 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 PMF1Q6P1K2 205 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 TTC39CQ8N584 583 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 UROC1Q96N76 676 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 TLR10Q9BXR5 811 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 LHX5Q9H2C1 402 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 M0QZQ0 153 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 GABBR2O75899 941 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 BEST1O76090 585 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 ERBB2P04626 1255 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 MESDQ14696 234 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM199Q8N511 208 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 GOLGA8SH3BPF8 625 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 TADA2AO75478 443 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 DGKIO75912 1065 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms