RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443509.6

PRUNE2-208, Transcript of prune homolog 2, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PRUNE2, Length 12,356 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRUNE2-208	ENST00000443509	GIN1	Q9NXP7	522 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	USP17L5	A8MUK1	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	PRPSAP2	O60256	369 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	CYP3A4	P08684	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	PLS3	P13797	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	PSMC3	P17980	439 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	TM9SF1	O15321	606 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	TTLL4	Q14679	1199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	PIGU	Q9H490	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	LARGE1	O95461	756 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	OAT	P04181	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	PDHB	P11177	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	TAC1	P20366	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	CYP3A7	P24462	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	KIF22	Q14807	665 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509		F8W810	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	DLGAP3	O95886	979 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	AP1S2	P56377	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SIX5	Q8N196	739 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	TMC2	Q8TDI7	906 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	TP53INP1	Q96A56	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	S100A6	P06703	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	XKRX	Q6PP77	449 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	FAM161B	Q96MY7	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	NDN	Q99608	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	CENPX	A8MT69	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	NR1H2	P55055	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	GCNT1	Q02742	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	GJA10	Q969M2	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	TBCB	Q99426	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	LXN	Q9BS40	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	VAMP7	P51809	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	PRKAA2	P54646	552 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ANTXR2	P58335	489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SLC15A2	Q16348	729 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	EME1	Q96AY2	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509		M0QX08	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	GYPC	P04921	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	CASP7	P55210	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms