RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443090.1

GCSHP5-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 5, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP5, Length 522 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP5-201ENST00000443090 SPAG17Q6Q759 2223 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 BRSK2Q8IWQ3 736 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 MAB21L3Q8N8X9 362 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 C1orf127Q8N9H9 656 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 CXorf38Q8TB03 319 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 RIN3Q8TB24 985 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM213AQ9BRX8 229 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 KIF9Q9HAQ2 790 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 L1RE1Q9UN81 338 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 CLIC4Q9Y696 253 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 CHD8Q9HCK8 2581 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 EXTL3O43909 919 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 GAP43P17677 238 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 GPR15P49685 360 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 TSPY1Q01534 308 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 RUNX3Q13761 415 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 ACCSQ96QU6 501 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 PKMYT1Q99640 499 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 ABCB6Q9NP58 842 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 TDP1Q9NUW8 608 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 EXOC7Q9UPT5 735 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 LAMA1P25391 3075 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 GREB1Q4ZG55 1949 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 TADA3O75528 432 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 ITGB3P05106 788 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 CSH1P0DML2 217 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 CSH2P0DML3 217 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 TXNDC8Q6A555 127 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 TRIM68Q6AZZ1 485 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 MON1AQ86VX9 555 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 LRRC52Q8N7C0 313 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 STKLD1Q8NE28 680 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 SAAL1Q96ER3 474 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 ACBD6Q9BR61 282 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 EBF3Q9H4W6 596 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 TBC1D7Q9P0N9 293 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 SDK1Q7Z5N4 2213 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP5-201ENST00000443090 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa21.39■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 GARTP22102 1010 aa21.39■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 CASP5P51878 434 aa21.39■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 BFSP1Q12934 665 aa21.39■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.39■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.39■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 CEP68Q76N32 757 aa21.39■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 TMEM86AQ8N2M4 240 aa21.39■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 GDAP2Q9NXN4 497 aa21.39■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 ATG2BQ96BY7 2078 aa21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 NOL4O94818 638 aa21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 ADRB1P08588 477 aa21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 ARSAP15289 507 aa21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 CUL4AQ13619 759 aa21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 SV2BQ7L1I2 683 aa21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 SPATA18Q8TC71 538 aa21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 GAB3Q8WWW8 586 aa21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM84AQ96KN4 292 aa21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 MYRFLQ96LU7 910 aa21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 CLIC6Q96NY7 704 aa21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 ITGA11Q9UKX5 1188 aa21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 EML5Q05BV3 1969 aa21.37■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 GDF9O60383 454 aa21.37■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 HUS1O60921 280 aa21.37■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 GCNT3O95395 438 aa21.37■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 LDHAP00338 332 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 CYP2F1P24903 491 aa21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms