RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 CCDC26Q8TAB7 109 aa12.59□□□□□ -0.39
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PRAME-210ENST00000442481 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP12.58□□□□□ -0.4
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PRAME-210ENST00000442481 HVCN1Q96D96 273 aa12.57□□□□□ -0.4
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PRAME-210ENST00000442481 KBTBD4Q9NVX7 518 aa12.57□□□□□ -0.4
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PRAME-210ENST00000442481 DRD1P21728 446 aa12.56□□□□□ -0.4
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PRAME-210ENST00000442481 ZFYVE19Q96K21 471 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-210ENST00000442481 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
PRAME-210ENST00000442481 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
PRAME-210ENST00000442481 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-210ENST00000442481 OLFML3Q9NRN5 406 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-210ENST00000442481 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-210ENST00000442481 CACNA1GO43497 2377 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-210ENST00000442481 A0A0B4J269 797 aa12.55□□□□□ -0.4
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