RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435497.1

LINC00028-201, long intergenic non-protein coding RNA 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00028, Length 587 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00028-201ENST00000435497 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 PARVGQ9HBI0 331 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 TDP1Q9NUW8 608 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 DPP3Q9NY33 737 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 SLC8A2Q9UPR5 921 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 C2CD2Q9Y426 696 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 STYXL1Q9Y6J8 313 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 ATG13O75143 517 aa14.67□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 CCDC192P0DO97 292 aa14.67□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 SCP2P22307 547 aa14.67□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 AVPR1AP37288 418 aa14.67□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 SHC2P98077 582 aa14.67□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 TAF12Q16514 161 aa14.67□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 PLK5Q496M5 336 aa14.67□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 SDHAF4Q5VUM1 108 aa14.67□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.67□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 ADALQ6DHV7 355 aa14.67□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 MON1AQ86VX9 555 aa14.67□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.67□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.67□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.67□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.67□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 KPNA7A9QM74 516 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 SLC26A4O43511 780 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 TADA3O75528 432 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 AKAP3O75969 853 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 GJA4P35212 333 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 WNT7BP56706 349 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 GRIN1Q05586 938 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 TCEAL3Q969E4 200 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 AK8Q96MA6 479 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 HHIPQ96QV1 700 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 MYO16Q9Y6X6 1858 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 NUP205Q92621 2012 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 SOBPA7XYQ1 873 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 DCLK1O15075 740 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 KCNK5O95279 499 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 PLCG1P19174 1290 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 DRD1P21728 446 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 ADSSP30520 456 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 MPLP40238 635 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 UBA7P41226 1012 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 BFSP1Q12934 665 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 DDR2Q16832 855 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 RAD54LQ92698 747 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 CALML4Q96GE6 196 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 SLC22A12Q96S37 553 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 VPS45Q9NRW7 570 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 CSH1P0DML2 217 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 CSH2P0DML3 217 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 CYP2F1P24903 491 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 PDGFRLQ15198 375 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 SLFN12LQ6IEE8 588 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 SYT13Q7L8C5 426 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 PKMYT1Q99640 499 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 ECT2Q9H8V3 914 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 L1RE1Q9UN81 338 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 ANTXRLA6NF34 631 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 PPP1R37O75864 691 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 NOL4O94818 638 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 AMPD2Q01433 879 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 KCNA1Q09470 495 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 MTF1Q14872 753 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 ZNF77Q15935 545 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 CCDC142Q17RM4 750 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 SV2CQ496J9 727 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 FBXO43Q4G163 708 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 RNF43Q68DV7 783 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 CXorf38Q8TB03 319 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms