RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429968.5

RBM39-212, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 2,149 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-212ENST00000429968 PPEF2O14830 753 aa14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 LIASO43766 372 aa14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CILPO75339 1184 aa14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 IL18RAPO95256 599 aa14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CD48P09326 243 aa14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 GBP1P32455 592 aa14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ADCY8P40145 1251 aa14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 KYNUQ16719 465 aa14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 NLRP7Q8WX94 980 aa14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 PTPN18Q99952 460 aa14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 VTA1Q9NP79 307 aa14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 GJD2Q9UKL4 321 aa14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 NME7Q9Y5B8 376 aa14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 TRAPPC3O43617 180 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 LRCH4O75427 683 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 MICAL2O94851 1124 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 MCF2P10911 925 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CETPP11597 493 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ATF2P15336 505 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ITIH2P19823 946 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CDKN2BP42772 138 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 SLMAPQ14BN4 828 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 TRNP1Q6NT89 227 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 GPR142Q7Z601 462 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 HOOK3Q86VS8 718 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 XYLT1Q86Y38 959 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 PGM2Q96G03 612 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 SCLT1Q96NL6 688 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 PNMA3Q9UL41 463 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 LRRD1A4D1F6 860 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 MMP3P08254 477 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 HIC1Q14526 733 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 GRIK4Q16099 956 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 KIZQ2M2Z5 673 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 DPH6Q7L8W6 267 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 UBA3Q8TBC4 463 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 MAML3Q96JK9 1138 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ZWILCHQ9H900 591 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 NINJ2Q9NZG7 142 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.72□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 GAS8O95995 478 aa14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 PAEPP09466 180 aa14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CHN1P15882 459 aa14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 PSMA2P25787 234 aa14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 MMP13P45452 471 aa14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CORO7P57737 925 aa14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 P3H1Q32P28 736 aa14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 NIPA2Q8N8Q9 360 aa14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 C12orf29Q8N999 325 aa14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 HPDLQ96IR7 371 aa14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 LHX5Q9H2C1 402 aa14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 SETD4Q9NVD3 440 aa14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.71□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 EBAG9O00559 213 aa14.71□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 KRT3P12035 628 aa14.71□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 DYNLT1P63172 113 aa14.71□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 POU5F1BQ06416 359 aa14.71□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TMEM132DQ14C87 1099 aa14.71□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 OASLQ15646 514 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.71□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 C9orf72Q96LT7 481 aa14.71□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.71□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 LPIN3Q9BQK8 851 aa14.71□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.71□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GINS2Q9Y248 185 aa14.71□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 HES2Q9Y543 173 aa14.71□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 M0QYV0 167 aa14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 RASGRF2O14827 1237 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms