RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM132DQ14C87 1099 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC01465Q8N7H1 131 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CXorf38Q8TB03 319 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OSMRQ99650 979 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SNTG2Q9NY99 539 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANAPC5Q9UJX4 755 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MICAL2O94851 1124 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IL18RAPO95256 599 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NPTXRO95502 500 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LSM8O95777 96 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NUDT17P0C025 328 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RARGP13631 454 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ACVR2BQ13705 512 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 P3H1Q32P28 736 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C3orf20Q8ND61 904 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM121Q9BTD3 319 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TBK1Q9UHD2 729 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TULP2O00295 520 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EBAG9O00559 213 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MAGEB2O15479 319 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CELF2O95319 508 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MCF2P10911 925 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CREB1P16220 341 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GTF2A2P52657 109 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NDST1P52848 882 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NRLP54845 237 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PTK6Q13882 451 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CDO1Q16878 200 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AGBL2Q5U5Z8 902 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IZUMO3Q5VZ72 239 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CYP4F22Q6NT55 531 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ACAP3Q96P50 834 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCT8L2Q96SF2 557 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TINF2Q9BSI4 451 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BCO2Q9BYV7 579 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADAM33Q9BZ11 813 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EPN3Q9H201 632 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM49BQ9NUQ9 324 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DPP3Q9NY33 737 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PCDHGC3Q9UN70 934 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CILPO75339 1184 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LRCH4O75427 683 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCNG2Q16589 344 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HOOK3Q86VS8 718 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NLRP14Q86W24 1093 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM176AQ96HP8 235 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MLXIPLQ9NP71 852 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CITO14578 2027 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IQCA1LA6NCM1 817 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GOLGA8MH3BSY2 632 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RASGRF2O14827 1237 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CYP3A5P20815 502 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AKAP5P24588 427 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLMAPQ14BN4 828 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 QPCTQ16769 361 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RHBDF2Q6PJF5 856 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 XYLT1Q86Y38 959 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HSPH1Q92598 858 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RUNDC3BQ96NL0 473 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KLK14Q9P0G3 267 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WHRNQ9P202 907 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LIASO43766 372 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ITIH2P19823 946 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HIC1Q14526 733 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SYCP2LQ5T4T6 812 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RCOR2Q8IZ40 523 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MGARPQ8TDB4 240 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GRK7Q8WTQ7 553 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MAIP1Q8WWC4 291 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLCO2A1Q92959 643 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TLCD1Q96CP7 247 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NEU2Q9Y3R4 380 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SNX9Q9Y5X1 595 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BANF1O75531 89 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CHN1P15882 459 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IFNAR2P48551 515 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARSEP51690 589 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AUHQ13825 339 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DUSP28Q4G0W2 176 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CATSPER4Q7RTX7 472 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms