RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 DPH6Q7L8W6 267 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 GIPC2Q8TF65 315 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 SIX4Q9UIU6 781 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 GABRDO14764 452 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 CUTAO60888 179 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 F11P03951 625 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 CSH1P0DML2 217 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 CSH2P0DML3 217 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 CTHP32929 405 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 NLRP12P59046 1061 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 TSSK4Q6SA08 328 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 HINFPQ9BQA5 517 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 INTS13Q9NVM9 706 aa22.55■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF233A6NK53 670 aa22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 LHX1P48742 406 aa22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 BFSP1Q12934 665 aa22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 MYO1EQ12965 1108 aa22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA2013Q8IYS2 634 aa22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 SPEM1Q8N4L4 309 aa22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 IQUBQ8NA54 791 aa22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 UBE4BO95155 1302 aa22.54■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 NOL4O94818 638 aa22.53■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 KRT19P08727 400 aa22.53■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 PCSK1P29120 753 aa22.53■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 GAS6Q14393 721 aa22.53■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 SHC4Q6S5L8 630 aa22.53■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 WDR49Q8IV35 697 aa22.53■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.53■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.53■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.53■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 MYRFLQ96LU7 910 aa22.53■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.53■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.53■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 PTPRJQ12913 1337 aa22.53■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 HOXD13P35453 343 aa22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 AVPR1AP37288 418 aa22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 CXCL12P48061 93 aa22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 SOX9P48436 509 aa22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 CDR1P51861 262 aa22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 EHHADHQ08426 723 aa22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 WDR44Q5JSH3 913 aa22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 DHX58Q96C10 678 aa22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 NCDNQ9UBB6 729 aa22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 TNNC2P02585 160 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 GPR15P49685 360 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 ASIC1P78348 528 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 CCINQ13939 588 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 FAM171BQ6P995 826 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 MON1AQ86VX9 555 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 OSTM1Q86WC4 334 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 DCLK2Q8N568 766 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
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