RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 PFKMP08237 780 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 CTNNA2P26232 953 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 TMEM191CA6NGB0 347 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 MYO1FO00160 1098 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 PROSCO94903 275 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 LMO2P25791 158 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 PKDCCQ504Y2 493 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 RSAD1Q9HA92 442 aa22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 M0QYV0 167 aa22.19■■□□□ 1.14
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GPC1-202ENST00000420138 ERLIN1O75477 346 aa22.19■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 GSCP56915 257 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.19■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.19■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 UBA3Q8TBC4 463 aa22.19■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.19■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.19■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 RGS18Q9NS28 235 aa22.19■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 A8MXQ7 604 aa22.18■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 SPOPO43791 374 aa22.18■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 ERBB2P04626 1255 aa22.18■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 GABRB2P47870 512 aa22.18■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 CLCNKBP51801 687 aa22.18■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa22.18■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 PDCLQ13371 301 aa22.18■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 GPNMBQ14956 572 aa22.18■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 AADACL2Q6P093 401 aa22.18■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 DPH6Q7L8W6 267 aa22.18■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 C3orf20Q8ND61 904 aa22.18■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.18■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.18■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 CCDC66A2RUB6 948 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 SLC1A1P43005 524 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 WDR93Q6P2C0 686 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 OSTM1Q86WC4 334 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 TTC30AQ86WT1 665 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 RNF169Q8NCN4 708 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 APPL2Q8NEU8 664 aa22.17■■□□□ 1.14
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GPC1-202ENST00000420138 C9IYK1 514 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 OGDHQ02218 1023 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 STILQ15468 1287 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 DNAJC24Q6P3W2 148 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 XYLT1Q86Y38 959 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 C18orf8Q96DM3 657 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.17■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 PODXLO00592 558 aa22.16■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 INPPL1O15357 1258 aa22.16■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 PDGFRBP09619 1106 aa22.16■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 PYGMP11217 842 aa22.16■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 SKIP12755 728 aa22.16■■□□□ 1.14
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GPC1-202ENST00000420138 MCM3P25205 808 aa22.16■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 VSNL1P62760 191 aa22.16■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.16■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.16■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 PGBD4Q96DM1 585 aa22.16■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 MCEEQ96PE7 176 aa22.16■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 CYB561D2O14569 222 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 HUS1O60921 280 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 FGGP02679 453 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 SELPP16109 830 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 MAN1A1P33908 653 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 UPP1Q16831 310 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 AP1M1Q9BXS5 423 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 NR2E1Q9Y466 385 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 TULP2O00295 520 aa22.15■■□□□ 1.14
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