RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399687.3

ABCD1P4-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene ABCD1P4, Length 604 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P4-201ENST00000399687 ANXA13P27216 316 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 ASPAP45381 313 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 INCA1Q0VD86 236 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 DUSP4Q13115 394 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 KCNJ12Q14500 433 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 VSTM1Q6UX27 236 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 GBP6Q6ZN66 633 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 GCNAQ96QF7 691 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 BCO2Q9BYV7 579 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 ASAH2Q9NR71 780 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 USTQ9Y2C2 406 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 NCOR1O75376 2440 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 SYCE3A1L190 88 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 ZNF197O14709 1029 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 TRIM66O15016 1216 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 MAGEA11P43364 429 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 CYP27A1Q02318 531 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 TWF1Q12792 350 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 CUL2Q13617 745 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 FKBP15Q5T1M5 1219 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 CCL16O15467 120 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 PDGFRBP09619 1106 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 BMP1P13497 986 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 IL9P15248 144 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 PTPN2P17706 415 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 RFX1P22670 979 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 RAP1GAPP47736 663 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 ZNF165P49910 485 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 SLC8A3P57103 927 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 GCNT1Q02742 428 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 JAKMIP2Q96AA8 810 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 NDST4Q9H3R1 872 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 WEE2P0C1S8 567 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 CSH1P0DML2 217 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 CSH2P0DML3 217 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 CD58P19256 250 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 FSHRP23945 695 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 NDST1P52848 882 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 VWA3BQ502W6 1294 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 FAM171BQ6P995 826 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 OSTM1Q86WC4 334 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 SEMA4DQ92854 862 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 MYLPFQ96A32 169 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 TMEM209Q96SK2 561 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 CORO1BQ9BR76 489 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 MED10Q9BTT4 135 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 POMKQ9H5K3 350 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 CISHQ9NSE2 258 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 PTPRDP23468 1912 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 CILPO75339 1184 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 SEC24AO95486 1093 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 LMO2P25791 158 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 CDC25CP30307 473 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms