RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASB3Q9Y575 518 aa16.33■□□□□ 0.2
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 VNN2O95498 520 aa16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUSP4Q13115 394 aa16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GTF3C4Q9UKN8 822 aa16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NR2E1Q9Y466 385 aa16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYBPHLA2RUH7 354 aa16.31■□□□□ 0.2
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAVIN2O95810 425 aa16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDGFRBP09619 1106 aa16.31■□□□□ 0.2
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAGEA11P43364 429 aa16.31■□□□□ 0.2
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM81BQ96LP2 452 aa16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NT5C1BQ96P26 610 aa16.31■□□□□ 0.2
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAJC25Q9H1X3 360 aa16.31■□□□□ 0.2
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CITO14578 2027 aa16.3■□□□□ 0.2
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNJ18B7U540 433 aa16.3■□□□□ 0.2
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTPN2P17706 415 aa16.3■□□□□ 0.2
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 NT5C1AQ9BXI3 368 aa16.3■□□□□ 0.2
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRISPLD1Q9H336 500 aa16.3■□□□□ 0.2
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP8B3O60423 1300 aa16.29■□□□□ 0.2
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF197O14709 1029 aa16.29■□□□□ 0.2
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCED1BQ96HM7 432 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDST4Q9H3R1 872 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP16.29■□□□□ 0.2
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NME7Q9Y5B8 376 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 REV3LO60673 3130 aa16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYCE3A1L190 88 aa16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C19orf67A6NJJ6 358 aa16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LOC730098B7Z3J9 87 aa16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HCRTO43612 131 aa16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP2C2O75185 946 aa16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRN2O75325 713 aa16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RHOP08100 348 aa16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF165P49910 485 aa16.28■□□□□ 0.2
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