RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.81■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 SHC3Q92529 594 aa22.81■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.81■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.81■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 DENND3A2RUS2 1198 aa22.81■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 PIAS1O75925 651 aa22.81■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 CD97P48960 835 aa22.81■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 TFDP1Q14186 410 aa22.81■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.81■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 KLF11O14901 512 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 LPXNO60711 386 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 ARSEP51690 589 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 FOLH1Q04609 750 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 ERFEQ4G0M1 354 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 CCDC106Q9BWC9 280 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 USP17L10C9JJH3 530 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 SUPT3HO75486 399 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 BANF1O75531 89 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 ETS1P14921 441 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 PCSK6P29122 969 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 SERPINB8P50452 374 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 GPS1Q13098 491 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 ANKMY2Q8IV38 441 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 MARVELD2Q8N4S9 558 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 DCAKDQ8WVC6 231 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 VAV3Q9UKW4 847 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 DMTF1Q9Y222 760 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 ATP2A1O14983 1001 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 LIASO43766 372 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 SSTR1P30872 391 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 SLC16A2P36021 539 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 VAMP7P51809 220 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 TMC7Q7Z402 723 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 NUP93Q8N1F7 819 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 TTC17Q96AE7 1141 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 FAM111AQ96PZ2 611 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 ACSS3Q9H6R3 686 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 SLITRK3O94933 977 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 GSTO1P78417 241 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 MYBPC2Q14324 1141 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 MYLK3Q32MK0 819 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.79■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 PEX1O43933 1283 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 GLRA2P23416 452 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 HIC1Q14526 733 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 KLHL35Q6PF15 583 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 OGFOD1Q8N543 542 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 FNDC8Q8TC99 324 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 FAM20AQ96MK3 541 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 TBCCD1Q9NVR7 557 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 SOX13Q9UN79 622 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 CCDC160A6NGH7 325 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 TXNDC9O14530 226 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 GYS1P13807 737 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 CCNIQ14094 377 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 TLR1Q15399 786 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 ALLCQ8N6M5 410 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 FAM81BQ96LP2 452 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 LZTS1Q9Y250 596 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 DENRO43583 198 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 PSTPIP1O43586 416 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 ATF3P18847 181 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 SNAPC2Q13487 334 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 TBCCQ15814 346 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 SH2D5Q6ZV89 423 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.78■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms