RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 FBXO41Q8TF61 875 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF384Q8TF68 577 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM125Q96AQ2 219 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 LRIG1Q96JA1 1093 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 SARGQ9BW04 601 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 IMPG2Q9BZV3 1241 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF287Q9HBT7 754 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 PNPLA8Q9NP80 782 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 ASB6Q9NWX5 421 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 ZSCAN32Q9NX65 697 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 LRIT1Q9P2V4 623 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 STAP2Q9UGK3 403 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 SNX13Q9Y5W8 968 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD3E-201ENST00000362899 M0QYG6 137 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D4O60343 1298 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 SOAT2O75908 522 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 THP07101 528 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ELFN1P0C7U0 828 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 GATA3P23771 443 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 MC2RQ01718 297 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 KIAA0895LQ68EN5 471 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 VWA1Q6PCB0 445 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 LAYNQ6UX15 382 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM90A1Q86YD7 464 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 COLGALT2Q8IYK4 626 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC17A8Q8NDX2 589 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC30A5Q8TAD4 765 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 LPIN2Q92539 896 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 TIFAQ96CG3 184 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 TNIP3Q96KP6 325 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 KLHL32Q96NJ5 620 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 DMRTA2Q96SC8 542 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 C1orf43Q9BWL3 253 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 BTBD1Q9H0C5 482 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PCDHA6Q9UN73 950 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 L1RE1Q9UN81 338 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM50BQ9Y247 325 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 A0A1W2PS29 197 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ANO9A1A5B4 782 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 RHPN2P1A8MT19 583 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 TOR1BO14657 336 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PEX1O43933 1283 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 SUN1O94901 812 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 C1RP00736 705 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 GRPP07492 148 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 EN2P19622 333 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ITGALP20701 1170 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 FOLR3P41439 243 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PROK1P58294 105 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 NHLH1Q02575 133 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 CLNKQ7Z7G1 428 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PPP1R3BQ86XI6 285 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 MPP5Q8N3R9 675 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ACRBPQ8NEB7 543 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 TMIEQ8NEW7 156 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PJA1Q8NG27 643 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 TFAP2BQ92481 460 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ARNT2Q9HBZ2 717 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 GPR35Q9HC97 309 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 DMTF1Q9Y222 760 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 MED16Q9Y2X0 877 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 YY2O15391 372 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PRAMEF10O60809 474 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 AHSGP02765 367 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 SRGNP10124 158 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 KITP10721 976 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 CYP2C9P11712 490 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 KCNA2P16389 499 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PHKA1P46020 1223 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 MAPK10P53779 464 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 FOXF2Q12947 444 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC13A2Q13183 592 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 LRCH2Q5VUJ6 765 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM160B1Q5W0V3 765 aa3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms