RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 POU5F1BQ06416 359 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 CDC73Q6P1J9 531 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 DGKHQ86XP1 1220 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 MINDY2Q8NBR6 621 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 MOSPD2Q8NHP6 518 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 DEPDC7Q96QD5 511 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ARMC7Q9H6L4 198 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 VAV3Q9UKW4 847 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ANXA6P08133 673 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 PRKG1Q13976 671 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 PDZK1Q5T2W1 519 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 BICRALQ6AI39 1079 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM65Q6PJ69 517 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 GJB4Q9NTQ9 266 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 USE1Q9NZ43 259 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 LEMD3Q9Y2U8 911 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 FDFT1P37268 417 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 BCAR1P56945 870 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAPPC3LQ5T215 181 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF554Q86TJ5 538 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 CDC25CP30307 473 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 TCIRG1Q13488 830 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM83EQ2M2I3 478 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC22A9Q8IVM8 553 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 C1orf54Q8WWF1 131 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 SNPHO15079 494 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT33BQ14525 404 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 JAMLQ86YT9 394 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ACAD9Q9H845 621 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 RSAD1Q9HA92 442 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM161AQ9NX61 479 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 GNPATO15228 680 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ERO1BQ86YB8 467 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 NUP93Q8N1F7 819 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP39A1Q9NYL5 469 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 GSAPA4D1B5 854 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 C4orf33Q8N1A6 199 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC24A2Q9UI40 661 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 MYRFQ9Y2G1 1151 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 PDXKO00764 312 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 CHRNB3Q05901 458 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 C12orf60Q5U649 245 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF398Q8TD17 642 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ING3Q9NXR8 418 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ZSWIM5Q9P217 1185 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 E9PCH4 1651 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 BMP10O95393 424 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF699Q32M78 642 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGAP17Q68EM7 881 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 APPL2Q8NEU8 664 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 PHF11Q9UIL8 331 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 POTECB2RU33 542 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 XRCC4Q13426 336 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 SH3BP4Q9P0V3 963 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 CSADQ9Y600 493 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 CCNA2P20248 432 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 GMFBP60983 142 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 PDPRQ8NCN5 879 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 GLMNQ92990 594 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 HAVCR1Q96D42 359 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 TAGLN3Q9UI15 199 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 FTLP02792 175 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP6V1C1P21283 382 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 UBXN2AP68543 259 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 PDIA5Q14554 519 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 IYDQ6PHW0 289 aa11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms