RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 HLA-DRAP01903 254 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SOD2P04179 222 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ITGB1P05556 798 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MAPK8P45983 427 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PXNP49023 591 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 NTHL1P78549 312 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CUL4BQ13620 913 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 HADHQ16836 314 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SKIDA1Q1XH10 827 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MLKLQ8NB16 471 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 P2RX5Q93086 422 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TIGD1Q96MW7 591 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CBWD1Q9BRT8 395 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 FBXO44Q9H4M3 255 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 FAM86C1Q9NVL1 165 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MUTYHQ9UIF7 546 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SIT1Q9Y3P8 196 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TNFRSF10AO00220 468 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MAN2B1O00754 1011 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CNPP09543 421 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ERVK-21P61565 698 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ATP11AP98196 1134 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SGCGQ13326 291 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TDGQ13569 410 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SYCP2LQ5T4T6 812 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC24Q6P3W2 148 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GSTA5Q7RTV2 222 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GAS2L3Q86XJ1 694 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB119Q8N690 84 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 WNT8AQ9H1J5 351 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GCNT4Q9P109 453 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CFAP97Q9P2B7 532 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TSPAN1O60635 241 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GRAP2O75791 330 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 FGF19O95750 216 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CCNE1P24864 410 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 NOP14P78316 857 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CYP4F8P98187 520 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 IL17AQ16552 155 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DCAF6Q58WW2 860 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 C4orf32Q8N8J7 132 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 CCSER1Q9C0I3 900 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ELOVL4Q9GZR5 314 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 LMAN1LQ9HAT1 526 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 EVA1BQ9NVM1 165 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 VPS28Q9UK41 221 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GPR179Q6PRD1 2367 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ACACAQ13085 2346 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SOAT2O75908 522 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 EDNRBP24530 442 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SDC4P31431 198 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 IRS1P35568 1242 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TIE1P35590 1138 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 THOP1P52888 689 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MYL6P60660 151 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 NAALADL2Q58DX5 795 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 BPIFB1Q8TDL5 484 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 EDEM1Q92611 657 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PAGE5Q96GU1 130 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 FAM81BQ96LP2 452 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MTMR9Q96QG7 549 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 RBSNQ9H1K0 784 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ADAMTS10Q9H324 1103 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 RGS18Q9NS28 235 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SQORQ9Y6N5 450 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 UBE4BO95155 1302 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 H3BNC9 293 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ASS1P00966 412 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DNTTP04053 509 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 IL9P15248 144 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CHKAP35790 457 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CXCL12P48061 93 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 KIF11P52732 1056 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CDH8P55286 799 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 VWA3BQ502W6 1294 aa4.69□□□□□ -1.66
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