RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 DCTN3O75935 186 aa22.62■■□□□ 1.21
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PTDSS1-201ENST00000337004 MYO1EQ12965 1108 aa22.62■■□□□ 1.21
PTDSS1-201ENST00000337004 TRPC3Q13507 836 aa22.62■■□□□ 1.21
PTDSS1-201ENST00000337004 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.62■■□□□ 1.21
PTDSS1-201ENST00000337004 WDTC1Q8N5D0 677 aa22.62■■□□□ 1.21
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PTDSS1-201ENST00000337004 MYLK2Q9H1R3 596 aa22.62■■□□□ 1.21
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PTDSS1-201ENST00000337004 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
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PTDSS1-201ENST00000337004 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.61■■□□□ 1.21
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PTDSS1-201ENST00000337004 A8MUI8 341 aa22.6■■□□□ 1.21
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PTDSS1-201ENST00000337004 MSCO60682 206 aa22.58■■□□□ 1.21
PTDSS1-201ENST00000337004 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
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PTDSS1-201ENST00000337004 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
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PTDSS1-201ENST00000337004 KLHL38Q2WGJ6 581 aa22.57■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF699Q32M78 642 aa22.57■■□□□ 1.2
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PTDSS1-201ENST00000337004 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.57■■□□□ 1.23e-7■■□□□ 11.6
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