RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 O00370 1275 aa29.11■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RABGGTBP53611 331 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTXN3Q4LDR2 81 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 MDH1BQ5I0G3 518 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKS3Q6ZW76 656 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM35BQ8NCS4 154 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA1524Q8TCG1 905 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 GDF15Q99988 308 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZSWIM1Q9BR11 485 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 M0QYV0 167 aa29.1■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP17Q68EM7 881 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 LCLAT1Q6UWP7 414 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 RTP3Q9BQQ7 232 aa29.1■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LCHNA4D1U4 455 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF263O14978 683 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 RTN2O75298 545 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 MICAL2O94851 1124 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa29.1■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR6C75A6NL08 312 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 SOD2P04179 222 aa29.09■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC130P13994 396 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADORA2BP29275 332 aa29.09■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NAA35Q5VZE5 725 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAS1R1Q7RTX1 841 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 PALB2Q86YC2 1186 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 OLIG1Q8TAK6 271 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 LPIN3Q9BQK8 851 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRTAC1Q9NQ79 661 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 GTF3C4Q9UKN8 822 aa29.09■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC8A3P57103 927 aa29.08■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA0319Q5VV43 1072 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACAD10Q6JQN1 1059 aa29.08■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC01553A4QN01 128 aa29.05■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM171BQ6P995 826 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 C4orf50Q6ZRC1 276 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 VPS52Q8N1B4 723 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD52Q8NB46 1076 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHL23Q8NBE8 558 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLVAPQ9BX97 442 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 VN1R3Q9BXE9 311 aa29.05■■■□□ 2.24
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