RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316881.8

TRIM25-201, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM25, Length 5,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-201ENST00000316881 ADGRB1O14514 1584 aa14.92□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 M0QYT0 321 aa14.92□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 KRT16P08779 473 aa14.92□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 RAB27AP51159 221 aa14.92□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 OSBPL8Q9BZF1 889 aa14.92□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.92□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 PRR23AA6NEV1 266 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 KRT4P19013 534 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 LHX1P48742 406 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 HPCAP84074 193 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 CUL2Q13617 745 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 C6orf10Q5SRN2 563 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 NLRP14Q86W24 1093 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 AGR3Q8TD06 166 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 GYPCP04921 128 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 PTGER2P43116 358 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 MAP3K10Q02779 954 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 GRIN1Q05586 938 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 33.2
TRIM25-201ENST00000316881 MRGBPQ9NV56 204 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 C2orf81A6NN90 581 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 NFIAQ12857 509 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 BHMTQ93088 406 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 TASP1Q9H6P5 420 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 METTL7BQ6UX53 244 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 MS4A14Q96JA4 679 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 TRABDQ9H4I3 376 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 SPACA6W5XKT8 324 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 VDRP11473 427 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 HERVK_113P62684 666 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 FLOT2Q14254 428 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 MIB1Q86YT6 1006 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.91□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 RHOBTB1O94844 696 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 TMEM253P0C7T8 217 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 KLRK1P26718 216 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 GEMP55040 296 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 SYCP2LQ5T4T6 812 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 OTULINQ96BN8 352 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 APOL5Q9BWW9 433 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 CST8O60676 142 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 AKR1A1P14550 325 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 SERPINB4P48594 390 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 GPC2Q8N158 579 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 RUBCNQ92622 972 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 NEU2Q9Y3R4 380 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 DIP2AQ14689 1571 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 FBXO21O94952 628 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 PLD1Q13393 1074 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 TP53BP2Q13625 1128 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 CCDC157Q569K6 752 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 50.8
TRIM25-201ENST00000316881 CCDC90BQ9GZT6 254 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 H3BRB1 525 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 VTNP04004 478 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 TGFB3P10600 412 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 RBP3P10745 1247 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 ACADMP11310 421 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 SLC9A1P19634 815 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 RGS9BPQ6ZS82 235 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.9□□□□□ -0.02
TRIM25-201ENST00000316881 KRT87PA6NCN2 255 aa14.89□□□□□ -0.03
TRIM25-201ENST00000316881 MYL2P10916 166 aa14.89□□□□□ -0.03
TRIM25-201ENST00000316881 ZNF507Q8TCN5 953 aa14.89□□□□□ -0.03
TRIM25-201ENST00000316881 DDI1Q8WTU0 396 aa14.89□□□□□ -0.03
TRIM25-201ENST00000316881 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.89□□□□□ -0.03
TRIM25-201ENST00000316881 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms