RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 ADAM15Q13444 863 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 GJB7Q6PEY0 223 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 SARM1Q6SZW1 724 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 RTL10Q7L3V2 364 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 TCEAL8Q8IYN2 117 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 SHC3Q92529 594 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 IFNKQ9P0W0 207 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 DPP7Q9UHL4 492 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 REV3LO60673 3130 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 PATJQ8NI35 1801 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 LINC01565O15544 149 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 PAPLNO95428 1278 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 TPM3P06753 285 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 PBX1P40424 430 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF132P52740 706 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 RAD23BP54727 409 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ADCY1Q08828 1119 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC142Q17RM4 750 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 IQCEQ6IPM2 695 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ACOT1Q86TX2 421 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 NEK11Q8NG66 645 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 MYLPFQ96A32 169 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 PCED1BQ96HM7 432 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 IGFLR1Q9H665 355 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ABCB6Q9NP58 842 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 MAN1C1Q9NR34 630 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 EPHB6O15197 1021 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 CBFA2T2O43439 604 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 TBX10O75333 385 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 SEC24AO95486 1093 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 PAEPP09466 180 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 UVSSAQ2YD98 709 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 LIN9Q5TKA1 542 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM270Q6UE05 265 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 GPR88Q9GZN0 384 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.09□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 ZMYND10O75800 440 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 C8AP07357 584 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 SPATA31D3P0C874 917 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 HOXA9P31269 272 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 ELF1P32519 619 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 LTBRP36941 435 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 ORC1Q13415 861 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF394Q53GI3 561 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 FIGNQ5HY92 759 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 STK33Q9BYT3 514 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 CYP4F11Q9HBI6 524 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 CLDND1Q9NY35 253 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 CLEC1BQ9P126 229 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 CEP72Q9P209 647 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC42-201ENST00000293845 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms