RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-201ENST00000259365 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 RBP3P10745 1247 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 DPEP1P16444 411 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 BGNP21810 368 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 GLRA2P23416 452 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 CAV1Q03135 178 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 PDIK1LQ8N165 341 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 EXD1Q8NHP7 514 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF570Q96NI8 536 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 PAFAH2Q99487 392 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 GYG2O15488 501 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 LPXNO60711 386 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 UNC5CO95185 931 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 CCND1P24385 295 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 RAB6CQ53S08 254 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 WLSQ5T9L3 541 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 DENND1BQ6P3S1 775 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 SPATA18Q8TC71 538 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 PYGBP11216 843 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 CENPCQ03188 943 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 LMNB2Q03252 620 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 C7orf31Q8N865 590 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 FAF2Q96CS3 445 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 RREB1Q92766 1687 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 LGR5O75473 907 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 SERPINB3P29508 390 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 CDH6P55285 790 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 ARL4CP56559 192 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 TTC7BQ86TV6 843 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 SLC25A41Q8N5S1 370 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 AGR3Q8TD06 166 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 RAB6BQ9NRW1 208 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 CNTNAP1P78357 1384 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 RNF8O76064 485 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 ENO1P06733 434 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 APRTP07741 180 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 MRIQ9BWK5 157 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 MIS12Q9H081 205 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 CEP350Q5VT06 3117 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 MTA2O94776 668 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 EDN1P05305 212 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 FGFR1P11362 822 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 MUTP22033 750 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 ELK3P41970 407 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 RASSF2P50749 326 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 ARFIP2P53365 341 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 XKR3Q5GH77 459 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 FAM13CQ8NE31 585 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 STMN2Q93045 179 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 B4GALT5O43286 388 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 PSTPIP1O43586 416 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 PHBP35232 272 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 FAAP100Q0VG06 881 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 KRT81Q14533 505 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 LY6KQ17RY6 165 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 TTC1Q99614 292 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 SBF2Q86WG5 1849 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.05□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 RGS20O76081 388 aa14.05□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 RPL22P35268 128 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
TMOD1-201ENST00000259365 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms