RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253451.8

CCL25-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CCL25, Length 953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25-201ENST00000253451 ACBD6Q9BR61 282 aa16.72■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 RXFP1Q9HBX9 757 aa16.72■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.72■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 MYO6Q9UM54 1294 aa16.72■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 MYBPHLA2RUH7 354 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 TEX28O15482 410 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 PAEPP09466 180 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 TPM1P09493 284 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 CCDC130P13994 396 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 OR1D2P34982 312 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 CLCN1P35523 988 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 KRT9P35527 623 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 ADKP55263 362 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 ROR1Q01973 937 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 CREMQ03060 361 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 ARID5AQ03989 594 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 GRIN2CQ14957 1233 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 SLC39A12Q504Y0 691 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 SLC8B1Q6J4K2 584 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 GPR153Q6NV75 609 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 SLC47A2Q86VL8 602 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 CRYBG2Q8N1P7 616 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 C12orf29Q8N999 325 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 TFAP2BQ92481 460 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 MYLPFQ96A32 169 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 TNIP3Q96KP6 325 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 FAM161BQ96MY7 647 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 ZSWIM1Q9BR11 485 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 GTF3C4Q9UKN8 822 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 IRAK3Q9Y616 596 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL25-201ENST00000253451 MYO7AQ13402 2215 aa16.7■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 WDR27A2RRH5 827 aa16.7■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 VNN2O95498 520 aa16.7■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 NDUFV1P49821 464 aa16.7■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 ASIC2Q16515 512 aa16.7■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 SFMBT2Q5VUG0 894 aa16.7■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 PGLYRP2Q96PD5 576 aa16.7■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 KLHL5Q96PQ7 755 aa16.7■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa16.7■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 FNIP2Q9P278 1114 aa16.7■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 MYO9BQ13459 2157 aa16.7■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 CLDN5O00501 218 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 THAP12O43422 761 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 FERP16591 822 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 ADORA2BP29275 332 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 GNA15P30679 374 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 RAB33AQ14088 237 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 PTPROQ16827 1216 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 SGO2Q562F6 1265 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 FAM171BQ6P995 826 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 Q7L0L9 218 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 TTC9BQ8N6N2 239 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 TC2NQ8N9U0 490 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 EPS8L1Q8TE68 723 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 SLC20A1Q8WUM9 679 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 PCED1BQ96HM7 432 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 DNAJC7Q99615 494 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 B3GNT5Q9BYG0 378 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa16.69■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 MTMR11A4FU01 709 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 O00370 1275 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 ADH1AP07327 375 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 VDRP11473 427 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 CYP11B1P15538 503 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 PDE6CP51160 858 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 CYP27A1Q02318 531 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 PTK2Q05397 1052 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 GPR17Q13304 367 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 ARID5BQ14865 1188 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 TAF3Q5VWG9 929 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 FAM35AQ86V20 835 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 PALB2Q86YC2 1186 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 CNGA4Q8IV77 575 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 FUKQ8N0W3 1084 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 SLC2A14Q8TDB8 520 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 MED10Q9BTT4 135 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
CCL25-201ENST00000253451 DNAI2Q9GZS0 605 aa16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms