RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM221A6NGB7 291 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 M0R296 226 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 PODXLO00592 558 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 KRT86O43790 486 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 C1RP00736 705 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 PIGRP01833 764 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 KRT13P13646 458 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 JAM2P57087 298 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 SLC35F6Q8N357 371 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 HDAC7Q8WUI4 952 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 JAKMIP2Q96AA8 810 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 BICD1Q96G01 975 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 NOTCH4Q99466 2003 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 DEF6Q9H4E7 631 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 PCIF1Q9H4Z3 704 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 TRIM10Q9UDY6 481 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 FBXW11Q9UKB1 542 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD63C9JTQ0 380 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 AKR1B10O60218 316 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 TRIM49P0CI25 452 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 TRIM49CP0CI26 452 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 ADSSP30520 456 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 CYP27A1Q02318 531 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 CREMQ03060 361 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 RAPGEF1Q13905 1077 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 CBWD6Q4V339 395 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 CBWD3Q5JTY5 395 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 CBWD5Q5RIA9 395 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC122Q5T0U0 273 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC149Q6ZUS6 474 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 TSGA10Q9BZW7 698 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 LACRTQ9GZZ8 138 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 SLC38A7Q9NVC3 462 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 MRFAP1Q9Y605 127 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 LIG4P49917 911 aa18.58■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 VAMP7P51809 220 aa18.58■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 MYL7Q01449 175 aa18.58■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 SIGLEC14Q08ET2 396 aa18.58■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 ASIC2Q16515 512 aa18.58■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 EHBP1Q8NDI1 1231 aa18.58■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 MTRRQ9UBK8 725 aa18.58■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 GUCA1BQ9UMX6 200 aa18.58■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa18.58■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa18.58■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 KMT2EQ8IZD2 1858 aa18.58■□□□□ 0.57
HOXC6-201ENST00000243108 A0A0B4J269 797 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 PMM2O15305 246 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 P4HA2O15460 535 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 ZMYND10O75800 440 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 OR1D2P34982 312 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 PRKCIP41743 596 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 ZBTB6Q15916 424 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 C1orf220Q5T0J3 134 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 RDH13Q8NBN7 331 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 PRKD2Q9BZL6 878 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 DPP7Q9UHL4 492 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 CTAGE9A4FU28 777 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 PJA2O43164 708 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 CLTAP09496 248 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 ENPEPQ07075 957 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 TUBB2AQ13885 445 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 RAB33AQ14088 237 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 IQCEQ6IPM2 695 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 PLEKHO2Q8TD55 490 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 SPAG5Q96R06 1193 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 TUBB2BQ9BVA1 445 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 TFR2Q9UP52 801 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 SORCS3Q9UPU3 1222 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 CDY1Q9Y6F8 540 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 CLUHO75153 1309 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 LACTBL1A8MY62 500 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 ADRB2P07550 413 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 GARTP22102 1010 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 RPL9P32969 192 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 GUCY2FP51841 1108 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 DLG4P78352 724 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 KLHL30Q0D2K2 578 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 KIF5AQ12840 1032 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXC6-201ENST00000243108 LMO3Q8TAP4 145 aa18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms