RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ATF6P18850 670 aa23.82■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 FMO5P49326 533 aa23.82■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 TATDN2Q93075 761 aa23.82■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 MYADMQ96S97 322 aa23.82■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 SNX25Q9H3E2 840 aa23.82■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa23.82■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 RHOP08100 348 aa23.81■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 PTPN2P17706 415 aa23.81■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 SLC5A9Q2M3M2 681 aa23.81■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 HS6ST3Q8IZP7 471 aa23.81■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 LMO3Q8TAP4 145 aa23.81■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 ITFG1Q8TB96 612 aa23.81■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 PTPRDP23468 1912 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 TRIOO75962 3097 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 A8MXQ7 604 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF10AO00220 468 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 CYP2F1P24903 491 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 CCR2P41597 374 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 TUFMP49411 452 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 EPHA5P54756 1037 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 CFAP221Q4G0U5 840 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 PRSS36Q5K4E3 855 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 RNF135Q8IUD6 432 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 WHAMMQ8TF30 809 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 ABCB6Q9NP58 842 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 HMGXB4Q9UGU5 601 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 NR2E1Q9Y466 385 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 MOSPD3O75425 235 aa23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 P4HA1P13674 534 aa23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 FSHRP23945 695 aa23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 GPR15P49685 360 aa23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 KCNH2Q12809 1159 aa23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 MGAT5BQ3V5L5 792 aa23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 TMC8Q8IU68 726 aa23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 MYLPFQ96A32 169 aa23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 TCEAL4Q96EI5 215 aa23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 PCED1BQ96HM7 432 aa23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 FAXDC2Q96IV6 333 aa23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 CORO1BQ9BR76 489 aa23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.79■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 CCDC192P0DO97 292 aa23.78■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 ALDH1A3P47895 512 aa23.78■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 NDST1P52848 882 aa23.78■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 EPHB3P54753 998 aa23.78■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 INCA1Q0VD86 236 aa23.78■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 OTOP3Q7RTS5 596 aa23.78■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 CRYBG2Q8N1P7 616 aa23.78■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 PSMG2Q969U7 264 aa23.78■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 TWNKQ96RR1 684 aa23.78■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 IMPG2Q9BZV3 1241 aa23.78■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 CYP3A43Q9HB55 503 aa23.78■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 DACH1Q9UI36 760 aa23.78■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 PLD1Q13393 1074 aa23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 MDH1BQ5I0G3 518 aa23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 PAQR9Q6ZVX9 377 aa23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 GPR152Q8TDT2 470 aa23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 ARID3AQ99856 593 aa23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 B3GNT5Q9BYG0 378 aa23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 THAP9Q9H5L6 903 aa23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 TMEM30AQ9NV96 361 aa23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 EPS15L1Q9UBC2 864 aa23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 LIMD1Q9UGP4 676 aa23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 ASB3Q9Y575 518 aa23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 P4HA2O15460 535 aa23.76■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 LAMP2P13473 410 aa23.76■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 MAGEA11P43364 429 aa23.76■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 ORC1Q13415 861 aa23.76■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 DDR2Q16832 855 aa23.76■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 SDHAF4Q5VUM1 108 aa23.76■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 UNC93AQ86WB7 457 aa23.76■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.76■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 GIPC2Q8TF65 315 aa23.76■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 FGF13Q92913 245 aa23.76■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms