RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W REC104P33323 182 aa8.67□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W SEC24P40482 926 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W SAS2P40963 338 aa8.67□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W HAC1P41546 238 aa8.67□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W EGT2P42835 1041 aa8.67□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YFL054CP43549 646 aa8.67□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YGL118CP53132 145 aa8.67□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W MRPL19P53875 158 aa8.67□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YAP6Q03935 383 aa8.67□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W RPL7AP05737 244 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W RAD23P32628 398 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W ICS2P38284 255 aa8.66□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W SOH1P38633 127 aa8.66□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W COX16P47081 118 aa8.66□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W MIC26P50087 233 aa8.66□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W UBC13P52490 153 aa8.66□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W LPP1Q04396 274 aa8.66□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W CSM4Q08955 156 aa8.66□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W ADH2P00331 348 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W COX2P00410 251 aa8.65□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W MRS3P10566 314 aa8.65□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W TOM40P23644 387 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W FYV4P38783 130 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W RPF1P38805 295 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YPS6P40583 537 aa8.65□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W TDA4P47153 279 aa8.65□□□□□ -1.02
PRP4YPR178W YPT1P01123 206 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W SEC4P07560 215 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W SEC11P15367 167 aa8.64□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W NNK1P36003 928 aa8.64□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W MSL1P40567 111 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W ATP19P81451 68 aa8.64□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W GIM5Q04493 163 aa8.64□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W RAF1Q06891 181 aa8.64□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W YMR316C-AI2HB70 103 aa8.63□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W FPR2P32472 135 aa8.63□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W ZRT1P32804 376 aa8.63□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W YBR090CP38253 122 aa8.63□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W YHR173CP38864 112 aa8.63□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W PRY1P47032 299 aa8.63□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W COX18P53239 316 aa8.63□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W UPS3Q04006 179 aa8.63□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W LIP2Q06005 328 aa8.63□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W TAO3P40468 2376 aa8.63□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W ADE8P04161 214 aa8.62□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W TIR1P10863 254 aa8.62□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W HSP12P22943 109 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W MRP49P32388 137 aa8.62□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W YAR068WP39564 161 aa8.62□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W RKI1Q12189 258 aa8.62□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W GAR1P28007 205 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W SEC72P39742 193 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W ECO1P43605 281 aa8.61□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W POS5Q06892 414 aa8.61□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W PIN2Q12057 282 aa8.61□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W YLR302CO13544 120 aa8.61□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W RPI1P23250 407 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W MRPS5P33759 307 aa8.61□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W POP7P38291 140 aa8.61□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W YHP1Q04116 353 aa8.61□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W IZH3Q07959 543 aa8.61□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W FAS1P07149 2051 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W MBF1O14467 151 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W DDI2P0CH63 225 aa8.6□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W DDI3P0CH64 225 aa8.6□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W MRPL39P36533 70 aa8.6□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W CIN5P40917 295 aa8.6□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W YDL183CP48569 320 aa8.6□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W GRH1Q04410 372 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W SAL1D6W196 494 aa8.59□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W FEN2P25621 512 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W YGL015CP33199 130 aa8.59□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W YNR071CP53757 342 aa8.59□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PRP4YPR178W PIS1P06197 220 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W GPP2P40106 250 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W SDS23P53172 527 aa8.58□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W BRP1P53194 125 aa8.58□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W SSU72P53538 206 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W FIT2Q08906 153 aa8.58□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W ATO3Q12359 275 aa8.58□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W VPS13Q07878 3144 aa8.57□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W YFL068WP0CX99 160 aa8.57□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W YLL066W-AP0CY00 160 aa8.57□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W YLL067W-AP0CY01 160 aa8.57□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W ERS1P17261 260 aa8.57□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W PRY2P36110 329 aa8.57□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W YER084WP40057 128 aa8.57□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W DMA2P53924 522 aa8.57□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W MSC3Q05812 728 aa8.57□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W RFM1Q12192 310 aa8.57□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W YLR363W-AQ3E747 85 aa8.57□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W SCS22Q6Q595 175 aa8.57□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W ANB1P19211 157 aa8.56□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W YOX1P34161 385 aa8.56□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W YKR070WP36151 352 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W PRS4P38063 326 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.8 ms