RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	HPDL	Q96IR7	371 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	EXOC3	O60645	756 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	MOSPD3	O75425	235 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	NDUFA8	P51970	172 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	SMARCD2	Q92925	531 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	PSMG2	Q969U7	264 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	ASB16	Q96NS5	453 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	HPSE	Q9Y251	543 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	KLRC4	O43908	158 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	31.15	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	CYP24A1	Q07973	514 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	STK4	Q13043	487 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	PSMD2	Q13200	908 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	GRM2	Q14416	872 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMC8	Q8IU68	726 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	FSIP1	Q8NA03	581 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	GIPC2	Q8TF65	315 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPR88	Q9GZN0	384 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	TSC2	P49815	1807 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	PSMD6	Q15008	389 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	ACBD6	Q9BR61	282 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	LRRC3	Q9BY71	257 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SEMA3B-215	ENST00000621029	FGF19	O95750	216 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYL1	P05976	194 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	FCAR	P24071	287 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	GABRR2	P28476	465 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	VIPR2	P41587	438 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	GCNA	Q96QF7	691 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	CGRRF1	Q99675	332 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	BRD9	Q9H8M2	597 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	TCHH	Q07283	1943 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATF6	P18850	670 aa		31.12	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	LHX1	P48742	406 aa		31.12	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	MRE11	P49959	708 aa		31.12	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		31.12	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		31.12	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		31.12	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	MMS19	Q96T76	1030 aa		31.12	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	PHOX2B	Q99453	314 aa		31.12	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	FOXQ1	Q9C009	403 aa		31.12	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	CLSTN1	O94985	981 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	PCSK1	P29120	753 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRKCQ	Q04759	706 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	OSTM1	Q86WC4	334 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029		A0A1W2PQ27	194 aa		31.1	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029		A0A1W2PQ64	194 aa		31.1	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029		A0A1W2PQD8	194 aa		31.1	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	PHACTR2	O75167	634 aa		31.1	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	STARD6	P59095	220 aa		31.1	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRPC3	Q13507	836 aa		31.1	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		31.1	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	GAREM2	Q75VX8	874 aa		31.1	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		31.1	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	PSMC3	P17980	439 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPR158	Q5T848	1215 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	VIT	Q6UXI7	678 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	DPH6	Q7L8W6	267 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	31.09	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	YAF2	Q8IY57	180 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPATA18	Q8TC71	538 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	HCRT	O43612	131 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRR29	P0C7W0	189 aa		31.08	■■■□□ 2.57

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