RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 DLG4P78352 724 aa26.69■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 PRSS36Q5K4E3 855 aa26.69■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 OSTM1Q86WC4 334 aa26.69■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 TTC9BQ8N6N2 239 aa26.69■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa26.69■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 VRTNQ9H8Y1 702 aa26.69■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 ANHXE9PGG2 379 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 PHACTR2O75167 634 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 MICAL2O94851 1124 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 PCSK1P29120 753 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 TUFMP49411 452 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 EPHB3P54753 998 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 MYL6P60660 151 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 BIRC3Q13489 604 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 TDGQ13569 410 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 ZACNQ401N2 412 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 NPAS3Q8IXF0 933 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 PKMYT1Q99640 499 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 DNAJC25Q9H1X3 360 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 ASB3Q9Y575 518 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 DENND4CQ5VZ89 1909 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 ZNF197O14709 1029 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 WARSP23381 471 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 VAMP7P51809 220 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 WDR72Q3MJ13 1102 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 C1orf220Q5T0J3 134 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 CYP4A22Q5TCH4 519 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 FAM186BQ8IYM0 893 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 ADSSL1Q8N142 457 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 MKNK1Q9BUB5 465 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 GDE1Q9NZC3 331 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 MAN1B1Q9UKM7 699 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 TACC1O75410 805 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 HTR4Q13639 388 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 NCOA4Q13772 614 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 ASIC4Q96FT7 647 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 MMS19Q96T76 1030 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 ASAH2Q9NR71 780 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 TMLHEQ9NVH6 421 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 TMEM221A6NGB7 291 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 M0R296 226 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 VNN1O95497 513 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 TNNC1P63316 161 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 MGAT5BQ3V5L5 792 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 CLEC17AQ6ZS10 378 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 LRRC3Q9BY71 257 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 ABCB6Q9NP58 842 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 CETN3O15182 167 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 KRT13P13646 458 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 PPP1R2P41236 205 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 CCR2P41597 374 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 LRRC63Q05C16 580 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 FAM171BQ6P995 826 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 MTSS1LQ765P7 747 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 SV2AQ7L0J3 742 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 HS6ST3Q8IZP7 471 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 RSAD2Q8WXG1 361 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 PSMG2Q969U7 264 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 TCEAL4Q96EI5 215 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 TSG101Q99816 390 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 CDH9Q9ULB4 789 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 DUSP12Q9UNI6 340 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 SOAT2O75908 522 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 CEBPBP17676 345 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 ATF6P18850 670 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 STIM1Q13586 685 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 ZNF699Q32M78 642 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 ITIH5Q86UX2 942 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 TMC8Q8IU68 726 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 SLC44A3Q8N4M1 653 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 ING5Q8WYH8 240 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 SMOC2Q9H3U7 446 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 GTF3C4Q9UKN8 822 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 GREB1Q4ZG55 1949 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 PSMA7O14818 248 aa26.63■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 HCRTO43612 131 aa26.63■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 LMO2P25791 158 aa26.63■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 MORC3Q14149 939 aa26.63■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 CFAP221Q4G0U5 840 aa26.63■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD40Q6AI12 368 aa26.63■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 HFE2Q6ZVN8 426 aa26.63■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 FGF14Q92915 247 aa26.63■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
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