RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613394.4

HPS1-215, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-215ENST00000613394 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-215ENST00000613394 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
HPS1-215ENST00000613394 EXD1Q8NHP7 514 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-215ENST00000613394 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HPS1-215ENST00000613394 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-215ENST00000613394 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-215ENST00000613394 PSTPIP1O43586 416 aa14.52□□□□□ -0.08
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HPS1-215ENST00000613394 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
HPS1-215ENST00000613394 CYP1B1Q16678 543 aa14.52□□□□□ -0.08
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HPS1-215ENST00000613394 MANSC1Q9H8J5 431 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 CISHQ9NSE2 258 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 MYPNQ86TC9 1320 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 TXNDC9O14530 226 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 BGNP21810 368 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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