RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 SREBF1P36956 1147 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 EPC2Q52LR7 807 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 C4orf22Q6V702 233 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 CST8O60676 142 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 RABGAP1LQ5R372 815 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM48Q8IWZ4 208 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 SPRP35270 261 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 ARL8AQ96BM9 186 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 MS4A14Q96JA4 679 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 PTK6Q13882 451 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 RUBCNQ92622 972 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 USP27XA6NNY8 438 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 CPB2Q96IY4 423 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 FAM129AQ9BZQ8 928 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1W2PQJ5 194 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 THP07101 528 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 PPP1R36Q96LQ0 422 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM51Q9BSJ1 452 aa21.07■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 CKMP06732 381 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 CUL3Q13618 768 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 FAM83AQ86UY5 434 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 DNERQ8NFT8 737 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 GRAMD1AQ96CP6 724 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 SLC25A13Q9UJS0 675 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 MTMR12Q9C0I1 747 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 YY1AP1Q9H869 796 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 BOLA3Q53S33 107 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 COG1Q8WTW3 980 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 FAM161BQ96MY7 647 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 IPPQ9Y573 584 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 DIP2BQ9P265 1576 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 H0Y3Z8 333 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 SMAPO00193 183 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 CHRM3P20309 590 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 NR1I3Q14994 352 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 RFWD2Q8NHY2 731 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 KIF2CQ99661 725 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 APOL5Q9BWW9 433 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 DPP7Q9UHL4 492 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 ANXA9O76027 345 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 ARIH2O95376 493 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 PTGER2P43116 358 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 EPHB3P54753 998 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 HERVK_113P62684 666 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 LINC00523Q86TU6 105 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA1257Q9ULG3 409 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 CHMP2BQ9UQN3 213 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 CXCL11O14625 94 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 IL1R1P14778 569 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 KRT4P19013 534 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 LRRC1Q9BTT6 524 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 HEATR9A2RTY3 570 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF185O15231 689 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 STX7O15400 261 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 MED24O75448 989 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 VDRP11473 427 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 ACOT1Q86TX2 421 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 MIB1Q86YT6 1006 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 PSD3Q9NYI0 1048 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 SPAG6O75602 509 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 MYL2P10916 166 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 METTL7BQ6UX53 244 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 PRR23AA6NEV1 266 aa21.04■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 GYS2P54840 703 aa21.04■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.04■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 RBP3P10745 1247 aa21.04■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 IL10P22301 178 aa21.04■□□□□ 0.96
CTDP1-208ENST00000613122 CENPCQ03188 943 aa21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms