RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592701.2

EFTUD2-224, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-224ENST00000592701 UVRAGQ9P2Y5 699 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 CACNG4Q9UBN1 327 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 TBX21Q9UL17 535 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 L1RE1Q9UN81 338 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 SCN1AP35498 2009 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 M0QYV0 167 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 O00370 1275 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 HOXA2O43364 376 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 MICAL2O94851 1124 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 FTCDO95954 541 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 CALB1P05937 261 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 RFC2P35250 354 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 HADHBP55084 474 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 CNGA2Q16280 664 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 UPP1Q16831 310 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 LRRC26Q2I0M4 334 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 MON1BQ7L1V2 547 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 LIMS2Q7Z4I7 341 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 DAAM2Q86T65 1068 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 ACOT1Q86TX2 421 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 TMEM86AQ8N2M4 240 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 PDCL2Q8N4E4 241 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 TNIP3Q96KP6 325 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 NUP85Q9BW27 656 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 L2HGDHQ9H9P8 463 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 ARHGEF37A1IGU5 675 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 B3GAT3O94766 335 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 MTA2O94776 668 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 PDGFRBP09619 1106 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 ODC1P11926 461 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 MMP8P22894 467 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 RRM1P23921 792 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 TCTN1Q2MV58 587 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 WSCD1Q658N2 575 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 CNKSR3Q6P9H4 555 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 LCLAT1Q6UWP7 414 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 PEX26Q7Z412 305 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 ERICH1Q86X53 443 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 METTL23Q86XA0 190 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 RABGGTAQ92696 567 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 PAAF1Q9BRP4 392 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 HESX1Q9UBX0 185 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 CDC23Q9UJX2 597 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 TSPAN16Q9UKR8 245 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 COG5Q9UP83 839 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 HYOU1Q9Y4L1 999 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 MRFAP1Q9Y605 127 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 SAR1BQ9Y6B6 198 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 SCINQ9Y6U3 715 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 NCK2O43639 380 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 SLU7O95391 586 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 TCP1P17987 556 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 OR1G1P47890 313 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 LHX1P48742 406 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 AMPD2Q01433 879 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 PTP4A2Q12974 167 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 IKBKEQ14164 716 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 MEI1Q5TIA1 1274 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 ARHGAP17Q68EM7 881 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 C11orf63Q6NUN7 778 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 SLFN11Q7Z7L1 901 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 OSTM1Q86WC4 334 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 NPAS4Q8IUM7 802 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 CRYBG2Q8N1P7 616 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 WDTC1Q8N5D0 677 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 C12orf29Q8N999 325 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 LRRC57Q8N9N7 239 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 C3orf58Q8NDZ4 430 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 MNS1Q8NEH6 495 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 MYRIPQ8NFW9 859 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 UBA3Q8TBC4 463 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 SPATA18Q8TC71 538 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 HASPINQ8TF76 798 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 DPEP3Q9H4B8 488 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 SYNCQ9H7C4 482 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms