RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592535.5

APOC1-208, Transcript of apolipoprotein C1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene APOC1, Length 430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1-208ENST00000592535 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 PSMG2Q969U7 264 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 GDPD2Q9HCC8 539 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ASB3Q9Y575 518 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 COL4A2P08572 1712 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 HCRTO43612 131 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 PRR29P0C7W0 189 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 TNNI1P19237 187 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 TUFMP49411 452 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 TSPY1Q01534 308 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 SMARCB1Q12824 385 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 BECN1Q14457 450 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 GAREM2Q75VX8 874 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 FSIP1Q8NA03 581 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 GIPC2Q8TF65 315 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 SMARCD2Q92925 531 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 HPDLQ96IR7 371 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 CGRRF1Q99675 332 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 FOXQ1Q9C009 403 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 NCANO14594 1321 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 A0A1W2PQ27 194 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 A0A1W2PQ64 194 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 A0A1W2PQD8 194 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 EXOC3O60645 756 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 RPN1P04843 607 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 MYL1P05976 194 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 GABRR2P28476 465 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 VIPR2P41587 438 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 MRE11P49959 708 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 STARD6P59095 220 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 MYL7Q01449 175 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 PFKPQ01813 784 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 MYO1EQ12965 1108 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 PSMD2Q13200 908 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 VEPH1Q14D04 833 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 CCDC142Q17RM4 750 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 VITQ6UXI7 678 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ITIH5Q86UX2 942 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 DTWD2Q8NBA8 298 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 SPATA18Q8TC71 538 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ZNF516Q92618 1163 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 FNBP1Q96RU3 617 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 PKMYT1Q99640 499 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ACBD6Q9BR61 282 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 PTPRDP23468 1912 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 CACNA1HO95180 2353 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 GABRDO14764 452 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 GPR15P49685 360 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 PRKCQQ04759 706 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 LIMS2Q7Z4I7 341 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 STKLD1Q8NE28 680 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 SHDQ96IW2 340 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms