RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592170.5

SEH1L-209, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 5

Gene SEH1L, Length 787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-209ENST00000592170 TBKBP1A7MCY6 615 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 B4GALT3O60512 393 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 DDHD2O94830 711 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 FGBP02675 491 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 SERPING1P05155 500 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 WEE2P0C1S8 567 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 KRT5P13647 590 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 FERP16591 822 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 USP8P40818 1118 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 KCNJ6P48051 423 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 EPHB4P54760 987 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 CDK17Q00537 523 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 UPP1Q16831 310 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 CYP26C1Q6V0L0 522 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 ZNF365Q70YC5 407 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 ZNF280BQ86YH2 543 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 TMTC1Q8IUR5 882 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 FAM71AQ8IYT1 594 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 RABGGTAQ92696 567 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 TOP1MTQ969P6 601 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 MMS19Q96T76 1030 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 CHP1Q99653 195 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 PAAF1Q9BRP4 392 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 SDCBP2Q9H190 292 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 EYSQ5T1H1 3165 aa11.24□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 KIAA1671Q9BY89 1806 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 SOWAHDA6NJG2 315 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 ZBBXA8MT70 800 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 KPNA7A9QM74 516 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 CCDC172P0C7W6 258 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 SKILP12757 684 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 CD58P19256 250 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 PRKCIP41743 596 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 CDH8P55286 799 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 LILRA4P59901 499 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 TMEM240Q5SV17 173 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 HGSNATQ68CP4 663 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 FAM117BQ6P1L5 589 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 COLGALT2Q8IYK4 626 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 LRRC43Q8N309 656 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 C3orf58Q8NDZ4 430 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 CISHQ9NSE2 258 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 GDAP2Q9NXN4 497 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 DNAJB4Q9UDY4 337 aa11.23□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 CYP26A1O43174 497 aa11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 ARHGAP6O43182 974 aa11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 DGKIO75912 1065 aa11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 B3GAT3O94766 335 aa11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 KIF4AO95239 1232 aa11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 OR1G1P47890 313 aa11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 ZNF132P52740 706 aa11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 MTF1Q14872 753 aa11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 SOWAHAQ2M3V2 549 aa11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 TMEM270Q6UE05 265 aa11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 SENP8Q96LD8 212 aa11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 HAUS4Q9H6D7 363 aa11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 CNTN6Q9UQ52 1028 aa11.22□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa11.21□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 F8W810 466 aa11.21□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa11.21□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 CYB561D2O14569 222 aa11.21□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 HUS1O60921 280 aa11.21□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 CILPO75339 1184 aa11.21□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 CALCAP01258 141 aa11.21□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 PAX3P23760 479 aa11.21□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 BRCC3P46736 316 aa11.21□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 SLC11A1P49279 550 aa11.21□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.611e-5■■□□□ 14
SEH1L-209ENST00000592170 PDE6CP51160 858 aa11.21□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 PTK2Q05397 1052 aa11.21□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 INCA1Q0VD86 236 aa11.21□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 C9orf50Q5SZB4 431 aa11.21□□□□□ -0.61
SEH1L-209ENST00000592170 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms