RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	CLRN1	P58418	232 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	RIN1	Q13671	783 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	CSRP2	Q16527	193 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	PDSS2	Q86YH6	399 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	MBD6	Q96DN6	1003 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	TBATA	Q96M53	351 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	TLR10	Q9BXR5	811 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	JADE2	Q9NQC1	790 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	RLIM	Q9NVW2	624 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATP9B-223	ENST00000590608	TISP43	B9A030	160 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608		B9A039	149 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ACVR2A	P27037	513 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PTK2B	Q14289	1009 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	KCNAB1	Q14722	419 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	TAF12	Q16514	161 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	BORA	Q6PGQ7	559 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	RFX8	Q6ZV50	586 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	YAF2	Q8IY57	180 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	NME8	Q8N427	588 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PDPR	Q8NCN5	879 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	RABGGTA	Q92696	567 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A0B4J269	797 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A1W2PRX2	142 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608		J3KRW8	73 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	IRAK2	O43187	625 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	USP1	O94782	785 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	POMC	P01189	267 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	AMH	P03971	560 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM163B	P0C2L3	166 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ARL4C	P56559	192 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	FOXO1	Q12778	655 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	NFYC	Q13952	458 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	VMAC	Q2NL98	169 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	GPR135	Q8IZ08	494 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	CARF	Q8N187	725 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	DNER	Q8NFT8	737 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	RUBCN	Q92622	972 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	TFAP2C	Q92754	450 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	SCAMP4	Q969E2	229 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	SKA1	Q96BD8	255 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	SNX27	Q96L92	541 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	C20orf173	Q96LM9	149 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	TCF25	Q9BQ70	676 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608		B5MCH6	92 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	FCHO1	O14526	889 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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