RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNAB2Q13303 367 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD1Q15327 319 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM60Q495X7 471 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF280DQ6N043 979 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CXCL17Q6UXB2 119 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 HPS3Q969F9 1004 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 FBXW5Q969U6 566 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ISL2Q96A47 359 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 TBATAQ96M53 351 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 GDF15Q99988 308 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 BARHL2Q9NY43 387 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CPLX1O14810 134 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ADAM11O75078 769 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 THBDP07204 575 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CLTBP09497 229 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SCG2P13521 617 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ICAM3P32942 547 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 NAPAP54920 295 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ITGA7Q13683 1181 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 NEDD9Q14511 834 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ELF2Q15723 593 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 LONRF1Q17RB8 773 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 MCTP2Q6DN12 878 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 MIER2Q8N344 545 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 MPP4Q96JB8 637 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SGCZQ96LD1 299 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC138Q96M89 665 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM60Q9H2L4 133 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 MLXIPQ9HAP2 919 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 C6orf50Q9HD87 102 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1W2PPC1 479 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC66A2RUB6 948 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM43BA6NCK2 446 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 KIAA0355O15063 1070 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ARIH2O95376 493 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 POU2F2P09086 479 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 HSD3B1P14060 373 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PTGS1P23219 599 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 GNA11P29992 359 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ADCY7P51828 1080 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SP2Q02086 613 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGAP1Q07960 439 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PKN1Q16512 942 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 DGKDQ16760 1214 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 GPATCH11Q8N954 259 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 DEPTORQ8TB45 409 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 AFG1LQ8WV93 481 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 POF1BQ8WVV4 589 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CDHR1Q96JP9 859 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC26A6Q9BXS9 759 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PRO3102Q9H379 93 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PIDD1Q9HB75 910 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 MYH7BA7E2Y1 1941 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 GRIN2DO15399 1336 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM227AF5H4B4 570 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 STXBP3O00186 592 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 AURKAO14965 403 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 FIBPO43427 364 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 TIMM44O43615 452 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SIGLEC6O43699 453 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PFKFB2O60825 505 aa8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms