RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 ALG6Q9Y672 507 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF185O15231 689 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 MICAL2O94851 1124 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 COL6A1P12109 1028 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 SCNN1GP51170 649 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 GSCP56915 257 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 GRIK3Q13003 919 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 C1orf53Q5VUE5 145 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC01599Q8WXQ3 324 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA1Q92805 767 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAI2Q9GZS0 605 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 SCINQ9Y6U3 715 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 CAPN15O75808 1086 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 ORC1Q13415 861 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 MAMLD1Q13495 774 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 GPNMBQ14956 572 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP17Q68EM7 881 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 ERICH1Q86X53 443 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 APPL2Q8NEU8 664 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 ARMC5Q96C12 935 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 UROC1Q96N76 676 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 TOX2Q96NM4 488 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 LCMT1Q9UIC8 334 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 L1RE1Q9UN81 338 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM170AA1A519 330 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 PODXLO00592 558 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 HUS1O60921 280 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 GPD2P43304 727 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 UBXN4Q92575 508 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 RABGGTAQ92696 567 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 PARVAQ9NVD7 372 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 STRIP2Q9ULQ0 834 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 NBNO60934 754 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 PARNO95453 639 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 FGFR1P11362 822 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CTNNA2P26232 953 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 GABRB2P47870 512 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 TAP1Q03518 808 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 MESDQ14696 234 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 UPP1Q16831 310 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 PKDCCQ504Y2 493 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 OR6B3Q8NGW1 331 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA18Q8TC71 538 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CD101Q93033 1021 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CAPZA3Q96KX2 299 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 WNT8AQ9H1J5 351 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 SNX25Q9H3E2 840 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CYTH4Q9UIA0 394 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CYB561D2O14569 222 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 GABRDO14764 452 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 SETSIPP0DME0 302 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 COMTP21964 271 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CXCR5P32302 372 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC1A1P43005 524 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 PAFAH1B1P43034 410 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CLCNKBP51801 687 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 TUSC3Q13454 348 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CFAP221Q4G0U5 840 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 ADGRF2Q8IZF7 708 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM86AQ8N2M4 240 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 RASGEF1CQ8N431 466 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 PDCL2Q8N4E4 241 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 MSANTD4Q8NCY6 345 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 FEZF2Q8TBJ5 459 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 TSC1Q92574 1164 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 APBB2Q92870 758 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR35Q9P2L0 1181 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 A8MXQ7 604 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNK3O14649 394 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPN20Q4JDL3 420 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 ACOT1Q86TX2 421 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 OSTM1Q86WC4 334 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKLE1Q8NAG6 615 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF169Q8NCN4 708 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 C3orf20Q8ND61 904 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 ACTRT1Q8TDG2 376 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 SENP8Q96LD8 212 aa24.12■■□□□ 1.45
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