RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589057.5

APOC4-APOC2-202, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene APOC4-APOC2, Length 680 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NT5DC4Q86YG4 428 aa11.96□□□□□ -0.49
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 THEM5Q8N1Q8 247 aa11.96□□□□□ -0.49
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TTC8Q8TAM2 541 aa11.96□□□□□ -0.49
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM200AQ8TCP9 573 aa11.96□□□□□ -0.49
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11.96□□□□□ -0.49
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GIPC2Q8TF65 315 aa11.96□□□□□ -0.49
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MSANTD3Q96H12 275 aa11.96□□□□□ -0.49
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLC46A2Q9BY10 475 aa11.96□□□□□ -0.49
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa11.96□□□□□ -0.49
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TASP1Q9H6P5 420 aa11.96□□□□□ -0.49
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TMLHEQ9NVH6 421 aa11.96□□□□□ -0.49
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GTSE1Q9NYZ3 720 aa11.96□□□□□ -0.49
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa11.96□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 A0A087X0B3 334 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DPYSL4O14531 572 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GAP43P17677 238 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PDCP20941 246 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SYT1P21579 422 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CDC25CP30307 473 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CXCL12P48061 93 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NRLP54845 237 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TNK2Q07912 1038 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DMWDQ09019 674 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SMARCB1Q12824 385 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 VEPH1Q14D04 833 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SV2CQ496J9 727 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 Q6ZS52 159 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SV2BQ7L1I2 683 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 BRSK2Q8IWQ3 736 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SPEM1Q8N4L4 309 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C1orf127Q8N9H9 656 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CXorf38Q8TB03 319 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 BPIFB1Q8TDL5 484 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SAAL1Q96ER3 474 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM84AQ96KN4 292 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF560Q96MR9 790 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ACCSQ96QU6 501 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM213AQ9BRX8 229 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C2orf42Q9NWW7 574 aa11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 K7ESF4 209 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GCNT3O95395 438 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 F11P03951 625 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ITGB3P05106 788 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HOXC13P31276 330 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GPR15P49685 360 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LRRC32Q14392 662 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PPP2R5DQ14738 602 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PON2Q15165 354 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LPAL2Q16609 132 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PDCL2Q8N4E4 241 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 STKLD1Q8NE28 680 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 USP28Q96RU2 1077 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CBWD1Q9BRT8 395 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PARD6AQ9NPB6 346 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 L1RE1Q9UN81 338 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 AGAP1Q9UPQ3 857 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 EXOC7Q9UPT5 735 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FRYLO94915 3013 aa11.94□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GOLGA8IPA6NC78 632 aa11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GOLGA8JA6NMD2 632 aa11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LDHAP00338 332 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IDEP14735 1019 aa11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GARTP22102 1010 aa11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TXLNAP40222 546 aa11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PNPLA4P41247 253 aa11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FNTBP49356 437 aa11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NLRP12P59046 1061 aa11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PLCB2Q00722 1185 aa11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CCINQ13939 588 aa11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLC39A14Q15043 492 aa11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TAF12Q16514 161 aa11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DGKKQ5KSL6 1271 aa11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SDHAF4Q5VUM1 108 aa11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OSTM1Q86WC4 334 aa11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CMTM8Q8IZV2 173 aa11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CHFRQ96EP1 664 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms