RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM175Q9BSA9 504 aa32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 PACSIN1Q9BY11 444 aa32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 CALCAP01258 141 aa32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP11A1P05108 521 aa32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 NOMO3P69849 1222 aa32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 TIGD5Q53EQ6 642 aa32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM35BQ8NCS4 154 aa32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 VCPIP1Q96JH7 1222 aa32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 SUSD3Q96L08 255 aa32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 TAS2R14Q9NYV8 317 aa32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 TMCO5BA8MYB1 307 aa32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 NSFP46459 744 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 CD300LGQ6UXG3 332 aa32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 CYFIP2Q96F07 1278 aa32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSWIM1Q9BR11 485 aa32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 HTATIP2Q9BUP3 242 aa32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 TFR2Q9UP52 801 aa32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 TBKBP1A7MCY6 615 aa32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAPPC3O43617 180 aa32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 CAPN15O75808 1086 aa32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 DGKIO75912 1065 aa32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 WSCD1Q658N2 575 aa32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL23Q86XA0 190 aa32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM10Q9UDY6 481 aa32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 NCANO14594 1321 aa32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF4AO95239 1232 aa32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 ABL1P00519 1130 aa32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 MYBL1P10243 752 aa32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 TYMPP19971 482 aa32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1G1P47890 313 aa32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 GPC5P78333 572 aa32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 TCEAL1Q15170 157 aa32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP17Q68EM7 881 aa32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 CARNS1A5YM72 827 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 O00370 1275 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 ALDH2P05091 517 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 GNG11P61952 73 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 LCLAT1Q6UWP7 414 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 RHOT2Q8IXI1 618 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM58Q8NG06 486 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 RFFLQ8WZ73 363 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 NOX5Q96PH1 765 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 COLEC11Q9BWP8 271 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 GTF3C4Q9UKN8 822 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 NME7Q9Y5B8 376 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 DUSP10Q9Y6W6 482 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-206ENST00000588815 VWA8A3KMH1 1905 aa32.94■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 B4GALT3O60512 393 aa32.94■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR5P61964 334 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 FPGSQ05932 587 aa32.94■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 NAA35Q5VZE5 725 aa32.94■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 ACOT1Q86TX2 421 aa32.94■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJB4Q9UDY4 337 aa32.94■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHB8Q9UN66 801 aa32.94■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 MACROD2A1Z1Q3 448 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 PCSK1P29120 753 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 ORC1Q13415 861 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 OSTM1Q86WC4 334 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 RABGGTAQ92696 567 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 ALS2CR12Q96Q35 445 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 COL4A6Q14031 1691 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 UPP2O95045 317 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 CFHP08603 1231 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCB4P21439 1286 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 BRCC3P46736 316 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 GATMP50440 423 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF569Q5MCW4 686 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 MCOLN2Q8IZK6 566 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 THAP2Q9H0W7 228 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
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CAPNS1-206ENST00000588815 NRP1O14786 923 aa32.92■■■□□ 2.86
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CAPNS1-206ENST00000588815 HADHBP55084 474 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 MON1BQ7L1V2 547 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 PASD1Q8IV76 773 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 MSANTD4Q8NCY6 345 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF18AQ8NI77 898 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 CPA5Q8WXQ8 436 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAM28Q9UKQ2 775 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 CDH9Q9ULB4 789 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 TADA2AO75478 443 aa32.91■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 MICAL2O94851 1124 aa32.91■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 PDGFRBP09619 1106 aa32.91■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
CAPNS1-206ENST00000588815 HESX1Q9UBX0 185 aa32.91■■■□□ 2.86
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