RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 TRAPPC3O43617 180 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ADCY3O60266 1144 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 VIMP08670 466 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 FDX1P10109 184 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 CETPP11597 493 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 GAD2Q05329 585 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 OSBPL8Q9BZF1 889 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 DCLK3Q9C098 648 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ZNF408Q9H9D4 720 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 HMGXB4Q9UGU5 601 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 DNPEPQ9ULA0 475 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 FSCN2O14926 492 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 DIAPH2O60879 1101 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ARL10Q8N8L6 244 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 SLC17A8Q8NDX2 589 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ART4Q93070 314 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 CPB2Q96IY4 423 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 SPATA33Q96N06 139 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 RNPEPQ9H4A4 650 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 CSADQ9Y600 493 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 RLFQ13129 1914 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 PODXLO00592 558 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 MSCO60682 206 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.147e-8■■■■■ 40.9
CTIF-205ENST00000587860 MTA2O94776 668 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 PROSCO94903 275 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ATP6V1G2O95670 118 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 CENPCQ03188 943 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 TRPC3Q13507 836 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 AUHQ13825 339 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 PLCB4Q15147 1175 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 WDR72Q3MJ13 1102 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 XRRA1Q6P2D8 792 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 HVCN1Q96D96 273 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 YIPF2Q9BWQ6 316 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 PIDD1Q9HB75 910 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ANAPC5Q9UJX4 755 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ZNF148Q9UQR1 794 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 NFASCO94856 1347 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 LRRD1A4D1F6 860 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 GRAP2O75791 330 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 PRKCBP05771 671 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 TMEM62Q0P6H9 643 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 TAF5Q15542 800 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ZNF280DQ6N043 979 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 SEPT1Q8WYJ6 367 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 C12orf42Q96LP6 360 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ZNF570Q96NI8 536 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 CGRRF1Q99675 332 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 IMPG2Q9BZV3 1241 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 CXCL16Q9H2A7 254 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 NRBP2Q9NSY0 501 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 PHIPQ8WWQ0 1821 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 KRT1P04264 644 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 FESP07332 822 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ATF2P15336 505 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 IVDP26440 423 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 P3H1Q32P28 736 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ZNF365Q70YC5 407 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 LRRC34Q8IZ02 419 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 WDTC1Q8N5D0 677 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 SEC16BQ96JE7 1060 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 TMEM121Q9BTD3 319 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 TRIM4Q9C037 500 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 C15orf41Q9Y2V0 281 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 MCM3APO60318 1980 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 AHCYL1O43865 530 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 OAZ1P54368 228 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ZNF568Q3ZCX4 644 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 LIN9Q5TKA1 542 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 DENND1BQ6P3S1 775 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 CCDC33Q8N5R6 958 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 JOSD2Q8TAC2 188 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 MAGEC3Q8TD91 643 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 LRRC19Q9H756 370 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 PMM2O15305 246 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 VTNP04004 478 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 CD48P09326 243 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 MAGEA8P43361 318 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 EXOC3L1Q86VI1 746 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 FAM81AQ8TBF8 368 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.131e-10■■■■■ 102
CTIF-205ENST00000587860 TLCD1Q96CP7 247 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 WDR70Q9NW82 654 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 CYTH4Q9UIA0 394 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ATP8B3O60423 1300 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms