RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 BIRC5O15392 142 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 MED7O43513 233 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 TOM1O60784 492 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 SMIM24O75264 130 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT37O76014 449 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 GH1P01241 217 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 MT-ND3P03897 115 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT1P04264 644 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 ADRB2P07550 413 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 ASNSP08243 561 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 DHRS4L1P0CG22 281 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 MMP8P22894 467 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 GNA15P30679 374 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 PIK3CAP42336 1068 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 NPTX2P47972 431 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 SERPINB9P50453 376 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 PEX3P56589 373 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 AP2B1P63010 937 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 ZBTB16Q05516 673 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 MGAT5Q09328 741 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 NFIAQ12857 509 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 GPS1Q13098 491 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 NAB1Q13506 487 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 CUL2Q13617 745 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 MPP2Q14168 576 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 XKR9Q5GH70 373 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM47CQ5HY64 1035 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 DACT2Q5SW24 774 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 STYK1Q6J9G0 422 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 CYP4F22Q6NT55 531 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 AADACL2Q6P093 401 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAJC24Q6P3W2 148 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM47EQ6ZV65 393 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 BBS12Q6ZW61 710 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 ARCQ7LC44 396 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 OTOAQ7RTW8 1153 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAAF5Q86Y56 855 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF2BQ8N4N8 673 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 CYP2W1Q8TAV3 490 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC35B2Q8TB61 432 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 LZICQ8WZA0 190 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF333Q96JL9 665 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 CSRNP1Q96S65 589 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 CENPKQ9BS16 269 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 TSSK1BQ9BXA7 367 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 PCIF1Q9H4Z3 704 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 MANSC1Q9H8J5 431 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 CYP26B1Q9NR63 512 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 HACD3Q9P035 362 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 BCAP29Q9UHQ4 241 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 HAO1Q9UJM8 370 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 ASB3Q9Y575 518 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.12□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF487B1APH4 448 aa8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC16A4O15374 487 aa8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 PSAPP07602 524 aa8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 INHBAP08476 426 aa8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 ARP10275 920 aa8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 ITGB5P18084 799 aa8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT4P19013 534 aa8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 PTGER2P43116 358 aa8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 LIG4P49917 911 aa8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 SCNN1DP51172 638 aa8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC18A2Q05940 514 aa8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-202ENST00000586851 TFDP2Q14188 446 aa8.11□□□□□ -1.11
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