RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
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GGA3-209ENST00000580646 MYL5Q02045 173 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-209ENST00000580646 PPP3CAQ08209 521 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-209ENST00000580646 BIRC3Q13489 604 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-209ENST00000580646 TRPC3Q13507 836 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-209ENST00000580646 MTMR3Q13615 1198 aa10.61□□□□□ -0.71
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GGA3-209ENST00000580646 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
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GGA3-209ENST00000580646 IRF2BP1Q8IU81 584 aa10.61□□□□□ -0.71
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GGA3-209ENST00000580646 TRIM49CP0CI26 452 aa10.6□□□□□ -0.71
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GGA3-209ENST00000580646 ANO6Q4KMQ2 910 aa10.6□□□□□ -0.71
GGA3-209ENST00000580646 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
GGA3-209ENST00000580646 CDKAL1Q5VV42 579 aa10.6□□□□□ -0.71
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GGA3-209ENST00000580646 XYLT2Q9H1B5 865 aa10.6□□□□□ -0.71
GGA3-209ENST00000580646 SMOC2Q9H3U7 446 aa10.6□□□□□ -0.71
GGA3-209ENST00000580646 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
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GGA3-209ENST00000580646 XYLBO75191 536 aa10.59□□□□□ -0.71
GGA3-209ENST00000580646 TACC1O75410 805 aa10.59□□□□□ -0.71
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GGA3-209ENST00000580646 ZNF461Q8TAF7 563 aa10.59□□□□□ -0.71
GGA3-209ENST00000580646 SLC7A14Q8TBB6 771 aa10.59□□□□□ -0.71
GGA3-209ENST00000580646 PHOX2BQ99453 314 aa10.59□□□□□ -0.71
GGA3-209ENST00000580646 KCNH6Q9H252 994 aa10.59□□□□□ -0.71
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GGA3-209ENST00000580646 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.714e-11■■■■□ 24.4
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GGA3-209ENST00000580646 EPS15L1Q9UBC2 864 aa10.59□□□□□ -0.71
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GGA3-209ENST00000580646 POLIQ9UNA4 740 aa10.59□□□□□ -0.71
GGA3-209ENST00000580646 USP34Q70CQ2 3546 aa10.58□□□□□ -0.72
GGA3-209ENST00000580646 WDR27A2RRH5 827 aa10.58□□□□□ -0.72
GGA3-209ENST00000580646 OR6C75A6NL08 312 aa10.58□□□□□ -0.72
GGA3-209ENST00000580646 KCNJ18B7U540 433 aa10.58□□□□□ -0.72
GGA3-209ENST00000580646 GABRDO14764 452 aa10.58□□□□□ -0.72
GGA3-209ENST00000580646 HUS1O60921 280 aa10.58□□□□□ -0.72
GGA3-209ENST00000580646 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
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