RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579316.5

CSNK1D-211, Transcript of casein kinase 1 delta, humanhuman

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 692 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1D-211ENST00000579316 OXER1Q8TDS5 423 aa15.09■□□□□ 0.01
CSNK1D-211ENST00000579316 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CSNK1D-211ENST00000579316 ACAP3Q96P50 834 aa15.09■□□□□ 0.01
CSNK1D-211ENST00000579316 GCNAQ96QF7 691 aa15.09■□□□□ 0.01
CSNK1D-211ENST00000579316 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CSNK1D-211ENST00000579316 TUFT1Q9NNX1 390 aa15.09■□□□□ 0.01
CSNK1D-211ENST00000579316 TMEM74BQ9NUR3 256 aa15.09■□□□□ 0.01
CSNK1D-211ENST00000579316 DENND4CQ5VZ89 1909 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 ABLIM1O14639 778 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 SOAT2O75908 522 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 LARGE1O95461 756 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 MCF2P10911 925 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 PROZP22891 400 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.08■□□□□ 09e-9■■■■■ 27.8
CSNK1D-211ENST00000579316 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 ANO7Q6IWH7 933 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 LPCAT2Q7L5N7 544 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 CATSPER3Q86XQ3 398 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 HDDC3Q8N4P3 179 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 MDGA1Q8NFP4 955 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 RIN3Q8TB24 985 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 USP33Q8TEY7 942 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 CD101Q93033 1021 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 LPIN3Q9BQK8 851 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 TDP1Q9NUW8 608 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 SNX14Q9Y5W7 946 aa15.08■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 PCDH15Q96QU1 1955 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 FAM205CA6NFA0 338 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 K7ERI5 159 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 REC8O95072 547 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 ATF6P18850 670 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 TYMPP19971 482 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 LRPAP1P30533 357 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 AVPR1AP37288 418 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 P2RY2P41231 377 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 PTGER3P43115 390 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 USP37Q86T82 979 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 TMEM150AQ86TG1 271 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 CPA6Q8N4T0 437 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 IFT74Q96LB3 600 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 MTMR9Q96QG7 549 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 FNBP1Q96RU3 617 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 ECT2Q9H8V3 914 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 DKK4Q9UBT3 224 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 PILRBQ9UKJ0 227 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa15.07■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 ARHGEF35A5YM69 484 aa15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 MED24O75448 989 aa15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 CD59P13987 128 aa15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 HSPA4P34932 840 aa15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 TXKP42681 527 aa15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 TUFMP49411 452 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 BFSP1Q12934 665 aa15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 VEPH1Q14D04 833 aa15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 OVOS1Q6IE37 1185 aa15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 KIFAP3Q92845 792 aa15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 TNFRSF25Q93038 417 aa15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 LRIG1Q96JA1 1093 aa15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 MMP17Q9ULZ9 603 aa15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 SLC6A14Q9UN76 642 aa15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 RAXQ9Y2V3 346 aa15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.06■□□□□ 0
CSNK1D-211ENST00000579316 NEMFO60524 1076 aa15.05■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 OPHN1O60890 802 aa15.05■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 XBP1P17861 261 aa15.05■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 C19orf57Q0VDD7 668 aa15.05■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 CRY1Q16526 586 aa15.05■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.05■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 MPZL3Q6UWV2 235 aa15.05■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 CEP76Q8TAP6 659 aa15.05■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 TMEM134Q9H6X4 195 aa15.05■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 CAPN10Q9HC96 672 aa15.05■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 SPTA1P02549 2419 aa15.04■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 OBSL1O75147 1896 aa15.04■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 STK36Q9NRP7 1315 aa15.04■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa15.04■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 F11P03951 625 aa15.04■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 PSMA5P28066 241 aa15.04■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 NLRP12P59046 1061 aa15.04■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 PSMD2Q13200 908 aa15.04■□□□□ -0
CSNK1D-211ENST00000579316 MTF1Q14872 753 aa15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms