RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		10.11	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE4B	O95155	1302 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1B0GVL5	298 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM170B	A6NMN3	283 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	TNNI1	P19237	187 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	GABRR2	P28476	465 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	GDI1	P31150	447 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	VIPR2	P41587	438 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	LHX1	P48742	406 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	KRT85	P78386	507 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	MYL7	Q01449	175 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	PSMD2	Q13200	908 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	GRM2	Q14416	872 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR49	Q8IV35	697 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	PJA1	Q8NG27	643 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	SPATA18	Q8TC71	538 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	GIPC2	Q8TF65	315 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	DNASE1L2	Q92874	299 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	IRF7	Q92985	503 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	HPDL	Q96IR7	371 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM84A	Q96KN4	292 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	FNBP1	Q96RU3	617 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXQ1	Q9C009	403 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	USP25	Q9UHP3	1055 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	SIX4	Q9UIU6	781 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	L1RE1	Q9UN81	338 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		10.1	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	PROB1	E7EW31	1015 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	DPYSL4	O14531	572 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	GABRD	O14764	452 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF263	O14978	683 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	NCAM2	O15394	837 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRN2	O75325	713 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	PFKFB1	P16118	471 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ATF6	P18850	670 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	CD72	P21854	359 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	NBL1	P41271	181 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP2J2	P51589	502 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	PSMD6	Q15008	389 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR158	Q5T848	1215 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	VIT	Q6UXI7	678 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	GAREM2	Q75VX8	874 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	YAF2	Q8IY57	180 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	GCNA	Q96QF7	691 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	MMS19	Q96T76	1030 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	BCO2	Q9BYV7	579 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	EXOC1	Q9NV70	894 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		10.09	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	PTPRJ	Q12913	1337 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MAN2B1	O00754	1011 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	KLRC4	O43908	158 aa		10.08	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	GFRA3	O60609	400 aa		10.08	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms