RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564228.5

TCF4-222, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene TCF4, Length 1,915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-222	ENST00000564228	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	MORC4	Q8TE76	937 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	DYDC2	Q96IM9	177 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	ASB14	A6NK59	587 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	CDH16	O75309	829 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	PSMG1	O95456	288 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	TTC4	O95801	387 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	ALDH1A1	P00352	501 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	SLC9A1	P19634	815 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	STAT1	P42224	750 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	KRT76	Q01546	638 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	CDR2	Q01850	454 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	SP2	Q02086	613 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	USP4	Q13107	963 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	EPHA7	Q15375	998 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	TTC27	Q6P3X3	843 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	ARMCX2	Q7L311	632 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	C10orf82	Q8WW14	230 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	NRG4	Q8WWG1	115 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	SYNC	Q9H7C4	482 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	GALNT8	Q9NY28	637 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	C2CD2L	O14523	706 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	CCDC22	O60826	627 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	ASMTL	O95671	621 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	CCNE2	O96020	404 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	LYN	P07948	512 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	DES	P17661	470 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	ICAM3	P32942	547 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	CDK7	P50613	346 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	PSMC6	P62333	389 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	CAV1	Q03135	178 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	RASIP1	Q5U651	963 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	CCNJL	Q8IV13	435 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	ALG3	Q92685	438 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	LXN	Q9BS40	222 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	SYT11	Q9BT88	431 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	AAAS	Q9NRG9	546 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228		A8MXQ7	604 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	WDR64	B1ANS9	1081 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	CAPN9	O14815	690 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	SLITRK3	O94933	977 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	ITIH2	P19823	946 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	STAT4	Q14765	748 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	DBN1	Q16643	649 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	LY6K	Q17RY6	165 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	MAML3	Q96JK9	1138 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	PREB	Q9HCU5	417 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	EURL	Q9NYK6	297 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	DNM3	Q9UQ16	869 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	NFASC	O94856	1347 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	ANKRD62	A6NC57	917 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	TMCC1	O94876	653 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	ACSL3	O95573	720 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	ECEL1	O95672	775 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-222	ENST00000564228	PLA2G4B	P0C869	781 aa		11.66	□□□□□ -0.54

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