RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KRT39Q6A163 491 aa23.76■■□□□ 1.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FRMD5Q7Z6J6 570 aa23.76■■□□□ 1.39
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.76■■□□□ 1.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POLIQ9UNA4 740 aa23.76■■□□□ 1.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 YIPF1Q9Y548 306 aa23.76■■□□□ 1.39
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TAS1R2Q8TE23 839 aa23.74■■□□□ 1.39
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.73■■□□□ 1.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C2CD4DB7Z1M9 353 aa23.72■■□□□ 1.39
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ALDH1A3P47895 512 aa23.72■■□□□ 1.39
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DPCR1Q3MIW9 517 aa23.72■■□□□ 1.39
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.71■■□□□ 1.39
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMLHEQ9NVH6 421 aa23.71■■□□□ 1.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa23.71■■□□□ 1.39
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LMO2P25791 158 aa23.7■■□□□ 1.38
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.7■■□□□ 1.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PI4K2AQ9BTU6 479 aa23.7■■□□□ 1.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.7■■□□□ 1.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAB20Q9NX57 234 aa23.7■■□□□ 1.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CEP72Q9P209 647 aa23.7■■□□□ 1.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GTF3C4Q9UKN8 822 aa23.7■■□□□ 1.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COQ4Q9Y3A0 265 aa23.7■■□□□ 1.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RHOP08100 348 aa23.69■■□□□ 1.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PDGFRBP09619 1106 aa23.69■■□□□ 1.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC192P0DO97 292 aa23.69■■□□□ 1.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ASPAP45381 313 aa23.69■■□□□ 1.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NTHL1P78549 312 aa23.69■■□□□ 1.38
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