RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	LRP12	Q9Y561	859 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM75P	A6NK02	468 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PMM2	O15305	246 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PHF2	O75151	1096 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RHCE	P18577	417 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	GUCY1A2	P33402	732 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SREBF1	P36956	1147 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RENBP	P51606	427 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CDK17	Q00537	523 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RHD	Q02161	417 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	BTK	Q06187	659 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP3CA	Q08209	521 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SP140	Q13342	867 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	MUM1	Q2TAK8	710 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	MTX3	Q5HYI7	312 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA5	Q8NB90	893 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR156	Q8NFN8	814 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	COG1	Q8WTW3	980 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ERP27	Q96DN0	273 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	BOD1	Q96IK1	185 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SERINC2	Q96SA4	455 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	MYD88	Q99836	296 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	GJD2	Q9UKL4	321 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	DMTF1	Q9Y222	760 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GVC2	190 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC78	A2IDD5	438 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	AKR1B10	O60218	316 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TLR5	O60602	858 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBED1	O96006	694 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPA6	P17066	643 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	GPD1	P21695	349 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPN7	P35236	360 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RXRG	P48443	463 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC96	Q2M329	555 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC93	Q567U6	631 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	AFMID	Q63HM1	303 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	BRINP3	Q76B58	766 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SRL	Q86TD4	932 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CNPY4	Q8N129	248 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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