RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554691.5

PCNX1-207, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PCNX1, Length 4,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-207ENST00000554691 TRIM49P0CI25 452 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TRIM49CP0CI26 452 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 RAG1P15918 1043 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 STIP1P31948 543 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 CIITAP33076 1130 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 LIG4P49917 911 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 VAMP7P51809 220 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ROR1Q01973 937 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 RUNX1T1Q06455 604 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 DPYSQ14117 519 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ALLCQ8N6M5 410 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 NEDD1Q8NHV4 660 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ART4Q93070 314 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 LRRC39Q96DD0 335 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ZBTB18Q99592 522 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 APOL6Q9BWW8 343 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 MPP6Q9NZW5 540 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 CDYLQ9Y232 598 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 NCANO14594 1321 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 NBPF26B4DH59 902 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TM7SF2O76062 418 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 MED26O95402 600 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ASLP04424 464 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 LINGO3P0C6S8 592 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 BMP6P22004 513 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ME2P23368 584 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 MCAMP43121 646 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 KLK7P49862 253 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 RINLQ6ZS11 566 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TLK2Q86UE8 772 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 C18orf8Q96DM3 657 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 HEMGNQ9BXL5 484 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 PREBQ9HCU5 417 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 PNMA3Q9UL41 463 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 PSMD13Q9UNM6 376 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 PTPRUQ92729 1446 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 MYMKA6NI61 221 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 CHMP2AO43633 222 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 PHKG2P15735 406 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 GUCY1A2P33402 732 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 CPA2P48052 419 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 GALK1P51570 392 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 HPCAP84074 193 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 NR1D2Q14995 579 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 UGP2Q16851 508 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 FBXO11Q86XK2 927 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 AHI1Q8N157 1196 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 STX19Q8N4C7 294 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TTC39CQ8N584 583 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 FITM2Q8N6M3 262 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 IRGQQ8WZA9 623 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TEKT2Q9UIF3 430 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TCHHQ07283 1943 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 PEX11AO75192 247 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TCEA3O75764 348 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ARL4AP40617 200 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 AP3M2P53677 418 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 AQP5P55064 265 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms