RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	NCAN	O14594	1321 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	VWA8	A3KMH1	1905 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	F5	P12259	2224 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SFI1	A8K8P3	1242 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CYP11A1	P05108	521 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PROS1	P07225	676 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CXCL8	P10145	99 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DRD1	P21728	446 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ABCD1	P33897	745 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	AVPR1A	P37288	418 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	MPL	P40238	635 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	LILRA4	P59901	499 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	BFSP1	Q12934	665 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ELF2	Q15723	593 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SPATA1	Q5VX52	437 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	RNF43	Q68DV7	783 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	KCNK18	Q7Z418	384 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	METTL23	Q86XA0	190 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TTC8	Q8TAM2	541 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	LRRC15	Q8TF66	581 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	BICD1	Q96G01	975 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	EPSTI1	Q96J88	318 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SENP8	Q96LD8	212 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PNMA5	Q96PV4	448 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PANK2	Q9BZ23	570 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	GKN1	Q9NS71	199 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	EBF1	Q9UH73	591 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DERA	Q9Y315	318 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ACACB	O00763	2458 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	LACTBL1	A8MY62	500 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SPTLC2	O15270	562 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	OGT	O15294	1046 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DDIT3	P35638	169 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ME1	P48163	572 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	LIG4	P49917	911 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SPAG1	Q07617	926 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TNK2	Q07912	1038 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PDGFRL	Q15198	375 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PLK5	Q496M5	336 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SEZ6	Q53EL9	994 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	HYI	Q5T013	277 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SYT13	Q7L8C5	426 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PDILT	Q8N807	584 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ACD	Q96AP0	544 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ASB7	Q9H672	318 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	IL21	Q9HBE4	155 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TCHH	Q07283	1943 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	COL4A2	P08572	1712 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688		A0A087X0B3	334 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ANO9	A1A5B4	782 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PIR	O00625	290 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SLC26A4	O43511	780 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PRAMEF12	O95522	483 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	APBB3	O95704	486 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CAVIN2	O95810	425 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PIGR	P01833	764 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CSH1	P0DML2	217 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CSH2	P0DML3	217 aa		7.39	□□□□□ -1.23

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