RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550724.2

HECTD4-212, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD4, Length 587 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-212ENST00000550724 MUC6Q6W4X9 2439 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 HCRTO43612 131 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 MOSPD3O75425 235 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 MICAL2O94851 1124 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 GABRR2P28476 465 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 VIPR2P41587 438 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 PSMD6Q15008 389 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 BMT2Q1RMZ1 405 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 SLC44A4Q53GD3 710 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 OSTM1Q86WC4 334 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 TMC8Q8IU68 726 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 KIAA0895Q8NCT3 520 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 CXorf38Q8TB03 319 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 SPPL2BQ8TCT7 592 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 SMARCD2Q92925 531 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 PSMG2Q969U7 264 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 ELSPBP1Q96BH3 223 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 PHOX2BQ99453 314 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 CGRRF1Q99675 332 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 TMLHEQ9NVH6 421 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 ASB3Q9Y575 518 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa15.54■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 PHACTR2O75167 634 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 DCNP07585 359 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 ATF6P18850 670 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 FCARP24071 287 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 CASP4P49662 377 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 GPR15P49685 360 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 EPHA5P54756 1037 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 PFKPQ01813 784 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 PSMD2Q13200 908 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 TRPC3Q13507 836 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 STXBP5Q5T5C0 1151 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 GPR158Q5T848 1215 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 SDHAF4Q5VUM1 108 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 TMEM86AQ8N2M4 240 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 TOP6BLQ8N6T0 577 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 STKLD1Q8NE28 680 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 GOLGA5Q8TBA6 731 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 SHDQ96IW2 340 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 ASB16Q96NS5 453 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 GCNAQ96QF7 691 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 LRRC3Q9BY71 257 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 FOXQ1Q9C009 403 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 BRD9Q9H8M2 597 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 GDAP2Q9NXN4 497 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 GTF3C4Q9UKN8 822 aa15.53■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 A0A1W2PQ27 194 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 A0A1W2PQ64 194 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 A0A1W2PQD8 194 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 CST3P01034 146 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 PDGFRBP09619 1106 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 CD72P21854 359 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 GDI1P31150 447 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 LHX1P48742 406 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 NUBP1P53384 320 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 CYP4F8P98187 520 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 SMARCB1Q12824 385 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 BIRC3Q13489 604 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 UBXN2BQ14CS0 331 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 CCDC142Q17RM4 750 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 SOWAHAQ2M3V2 549 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 KRBA2Q6ZNG9 492 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 YAF2Q8IY57 180 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 DTWD2Q8NBA8 298 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 ACBD6Q9BR61 282 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 SIT1Q9Y3P8 196 aa15.52■□□□□ 0.08
HECTD4-212ENST00000550724 FGF19O95750 216 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 MYL1P05976 194 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 CYP2F1P24903 491 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 PCSK1P29120 753 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 MRE11P49959 708 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 TNNC1P63316 161 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 DDR2Q16832 855 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 CEP135Q66GS9 1140 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 VITQ6UXI7 678 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 TPRG1Q6ZUI0 275 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 GAREM2Q75VX8 874 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 SCN4BQ8IWT1 228 aa15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms