RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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CTDSP2-204ENST00000548823 GLUD2P49448 558 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 PARM1Q6UWI2 310 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 TAS1R1Q7RTX1 841 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 CEP89Q96ST8 783 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 DESI2Q9BSY9 194 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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CTDSP2-204ENST00000548823 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 KMT5AQ9NQR1 393 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 COL4A3Q01955 1670 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 EPHB6O15197 1021 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC16A4O15374 487 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 KRT83P78385 493 aa21.46■■□□□ 1.03
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CTDSP2-204ENST00000548823 DMWDQ09019 674 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 GBP6Q6ZN66 633 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 KSR1Q8IVT5 923 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 CLDN23Q96B33 292 aa21.46■■□□□ 1.03
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CTDSP2-204ENST00000548823 TBX20Q9UMR3 447 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A087WZ62 844 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 PFKPQ01813 784 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 SPEM2Q0P670 501 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 EXOC3L4Q17RC7 722 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 SYT10Q6XYQ8 523 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 EXOC8Q8IYI6 725 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 NELL2Q99435 816 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 MYO1AQ9UBC5 1043 aa21.45■■□□□ 1.02
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CTDSP2-204ENST00000548823 DOCK6Q96HP0 2047 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa21.44■■□□□ 1.02
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CTDSP2-204ENST00000548823 MTERF2Q49AM1 385 aa21.44■■□□□ 1.02
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CTDSP2-204ENST00000548823 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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CTDSP2-204ENST00000548823 MARCH5Q9NX47 278 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.44■■□□□ 1.02
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CTDSP2-204ENST00000548823 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.43■■□□□ 1.02
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CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF592Q92610 1267 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 IKZF4Q9H2S9 585 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 HAUS4Q9H6D7 363 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 L2HGDHQ9H9P8 463 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 AIPL1Q9NZN9 384 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 UQCRHLA0A096LP55 91 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 UQCRHP07919 91 aa21.42■■□□□ 1.02
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