RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544697.1

C12orf4-208, Transcript of chromosome 12 open reading frame 4, human

TSL 5

Gene C12orf4, Length 685 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C12orf4-208	ENST00000544697	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	COA7	Q96BR5	231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	F2RL2	O00254	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	TRIAP1	O43715	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	MAL	P21145	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	CCT8	P50990	548 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	TP73	O15350	636 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	LATS1	O95835	1130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	PRR35	P0CG20	571 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	DRD4	P21917	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	NDUFV1	P49821	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	KRT85	P78386	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	GJB1	P08034	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	PF4V1	P10720	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	JUP	P14923	745 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	CYP2C19	P33261	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	DSC2	Q02487	901 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	WASF1	Q92558	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	KEL	P23276	732 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	TBCC	Q15814	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C12orf4-208	ENST00000544697	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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